MirGeneDB ID | Aae-Mir-971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-971 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UGGUGUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Yellow fever mosquito (Aedes aegypti) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aga-Mir-971 Bge-Mir-971-v1 Bge-Mir-971-v2 Dan-Mir-971 Dlo-Mir-971 Dme-Mir-971 Dmo-Mir-971 Dsi-Mir-971 Dya-Mir-971 Gpa-Mir-971 Hme-Mir-971 Tca-Mir-971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Aaeg_L3) |
supercont1.141: 748863-748925 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGGAGAAAACUUUGGCCCUGCAGUUCGGCUGGCUGUAAGUAUUACAGCAAGCUUGCUAUUCGAAAGGCGCUUGGUGUUAUAUCUUACAGUGAGCUGAGUCGUGGCAGAAUGCAACCCUUUUUCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GGGAGAAAACUUUGGCC-- UG AG G -| U G UUGCUAU C C UUCGGCU GCUGUAAG UAU ACA CAAGC U G G GAGUCGA UGACAUUC AUA UGU GUUCG C CUUUUUCCCAACGUAAGAC GU CU G U^ U G CGGAAAG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Aae-Mir-971_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GGCUGUAAGUAUUACAGCAAGC -22
Get sequence
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Mature sequence | Aae-Mir-971_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UUGGUGUUAUAUCUUACAGUGAG -63
Get sequence
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