MirGeneDB ID | Aca-Mir-191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-191 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AACGGAA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Green anole lizard (Anolis carolinensis) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aca-mir-191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ami-Mir-191 Bta-Mir-191 Cfa-Mir-191 Cmi-Mir-191 Cpi-Mir-191 Cpo-Mir-191 Dno-Mir-191 Dre-Mir-191 Ete-Mir-191 Gga-Mir-191-v1 Gga-Mir-191-v2 Gja-Mir-191 Gmo-Mir-191 Hsa-Mir-191 Loc-Mir-191 Mal-Mir-191 Mdo-Mir-191 Mml-Mir-191 Mmu-Mir-191 Mun-Mir-191 Oan-Mir-191 Ocu-Mir-191 Pbv-Mir-191 Rno-Mir-191 Sha-Mir-191 Spt-Mir-191 Sto-Mir-191 Tgu-Mir-191 Tni-Mir-191 Xla-Mir-191-P1 Xla-Mir-191-P2 Xtr-Mir-191 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (anoCar2) |
2: 187865108-187865171 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-191) |
Mir-2970
2: 187861425-187861483 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-425 2: 187863035-187863096 [-] UCSC Ensembl Mir-191 2: 187865108-187865171 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUCACCUUCCAAUGAUGGUUUGAUAGUGGGCAACGGAAUCCCAAAAGCAGCUGUUUUCCUCUUAAAGUUCCAGCUGCACUUGGAUUUCGUUCCUUGCUUUCCUACCCUUCUCUCCUGGAUUGUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AUCACCUUCCAAUGAUG--| UU U UG C C AA UUUUCCUC GU GA AG GG AACGGAAUCC AA GCAGCUG \ CA CU UC UC UUGCUUUAGG UU CGUCGAC U GUGUUAGGUCCUCUCUUCC^ UC U GU C - CA CUUGAAAU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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Comment | There is a second Dicer cut -1 on both arms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Aca-Mir-191_5p |
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mirBase accession | MIMAT0021824 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CAACGGAAUCCCAAAAGCAGCUG -23
Get sequence
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Star sequence | Aca-Mir-191_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0021825 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
42- GCUGCACUUGGAUUUCGUUCCU -64
Get sequence
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