MirGeneDB ID | Aga-Mir-929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-929 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAUUGAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | African malaria mosquito (Anopheles gambiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aga-mir-929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-929-P1 Aae-Mir-929-P2 Bge-Mir-929-v1 Bge-Mir-929-v2 Dan-Mir-929 Dlo-Mir-929-v1 Dlo-Mir-929-v2 Dme-Mir-929 Dmo-Mir-929 Dsi-Mir-929 Dya-Mir-929 Gpa-Mir-929 Hme-Mir-929 Tca-Mir-929 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Neoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_943734735.2_idAnoGambNW_F1_1_genomic) |
NC_064601.1: 38209191-38209249 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGUUUCUCGUGUAUGCCUACGCGUGGGAUUAAAUUGACUCUAGUAGGGAGUCCUUUUAUACGAGCGACUCCCUAACGGAGUCAGAUUGAUUCCGGUAGUGCACCUGUCGACAGCAAGCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UGUUUCUCGUGUAUGCCUAC ----| A AG CCUUUUA GCG UGGGAUUAA UUGACUCU UAGGGAGU \ CGU GCCUUAGUU GACUGAGG AUCCCUCA U ACGAACGACAGCUGUCCA-- GAUG^ A CA GCGAGCA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Aga-Mir-929_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AAAUUGACUCUAGUAGGGAGU -21
Get sequence
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Star sequence | Aga-Mir-929_3p* (predicted) |
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mirBase accession | MIMAT0010101 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- UCCCUAACGGAGUCAGAUUGA -59
Get sequence
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