MirGeneDB ID | Bta-Mir-582-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-582 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AACCAGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cow (Bos taurus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | bta-mir-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Bta-Mir-582-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-582-v2 Cja-Mir-582 Cpo-Mir-582-v2 Dno-Mir-582-v2 Eca-Mir-582 Hsa-Mir-582-v2 Laf-Mir-582-v2 Mml-Mir-582-v2 Mmr-Mir-582-v2 Mmu-Mir-582-v2 Ocu-Mir-582 Pab-Mir-582-v2 Rno-Mir-582-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_002263795.1_ARS-UCD1.2_BTA) |
NC_037347.1: 19584398-19584455 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-582-v2) |
Mir-582-v1
NC_037347.1: 19584397-19584456 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-582-v2 NC_037347.1: 19584398-19584455 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACCUCAACACUUCAAUCUGUUCUCUUUGGUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUACCUAAUUGUAACCAGUUGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAAGUGAAAACAUUUCUUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 ACCUCAACACUUCAAUC--| U UUA CA UAAUCU UGU CUCUUUGG CAGUUGUUCAAC GUUAC A ACG GGGAAACC GUCAACAAGUUG CAAUG C GUUUCUUUACAAAAGUGAA^ U CAA AC UUAAUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Bta-Mir-582-v2_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0009351 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACAGUUGUUCAACCAGUUACU -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: bta-miR-582 |
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Mature sequence | Bta-Mir-582-v2_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- UAACCAGUUGAACAACUGAACC -58
Get sequence
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