MirGeneDB ID | Cfa-Mir-582-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-582 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACAGUUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cfa-mir-582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Cfa-Mir-582-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-582-v2 Cja-Mir-582 Cpo-Mir-582-v2 Dno-Mir-582-v2 Eca-Mir-582 Hsa-Mir-582-v2 Laf-Mir-582-v2 Mml-Mir-582-v2 Mmr-Mir-582-v2 Mmu-Mir-582-v2 Ocu-Mir-582 Pab-Mir-582-v2 Rno-Mir-582-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (canFam3_add) |
chr2: 46497283-46497340 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-582-v2) |
Mir-582-v1
chr2: 46497282-46497341 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-582-v2 chr2: 46497283-46497340 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACCUCAACACUUCAGUCUGUACUCUUUGGUUACAGUUGUUCAACCAGUUACUAAUCUAGCUAAUUGUAACCAGUUGAACAACUGAACCCAAAGGGUGCAAAGUGGAAACAUUUCAUUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 ACCUCAACACUUCAGUC--| UUA CA UAAUCU UGUACUCUUUGG CAGUUGUUCAAC GUUAC A ACGUGGGAAACC GUCAACAAGUUG CAAUG G GUUACUUUACAAAGGUGAA^ CAA AC UUAAUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Cfa-Mir-582-v2_5p |
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mirBase accession | MIMAT0009916 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UACAGUUGUUCAACCAGUUACU -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-582 miRDB: MIMAT0009916 |
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Star sequence | Cfa-Mir-582-v2_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- UAACCAGUUGAACAACUGAACC -58
Get sequence
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