MirGeneDB ID | Cfa-Mir-151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-151 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CGAGGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cfa-mir-151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-151 Cja-Mir-151 Cpo-Mir-151 Dno-Mir-151 Eca-Mir-151 Ete-Mir-151 Hsa-Mir-151 Laf-Mir-151 Mml-Mir-151 Mmr-Mir-151 Mmu-Mir-151 Ocu-Mir-151 Pab-Mir-151 Rno-Mir-151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (canFam3_add) |
chr13: 35353689-35353744 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGCAAGAGGACUACAGCACCUUUCCUGCCCUCGAGGAGCUCACAGUCUAGUAUGUCUCAGCCCUACUAGACUGAGGCUCCUUGAGGGCAGGGAUCGUCAUACUCGCCUCAGUGCUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GGCAAGAGGACUACAGC--| CU CA UGUCU AC UUCCUGCCCUCGAGGAGCU CAGUCUAGUA \ UG AGGGACGGGAGUUCCUCGG GUCAGAUCAU C GUCGUGACUCCGCUCAUAC^ CU A- CCCGA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Cfa-Mir-151_5p |
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mirBase accession | MIMAT0006615 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCGAGGAGCUCACAGUCUAGUA -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-151 miRDB: MIMAT0006615 |
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Co-mature sequence | Cfa-Mir-151_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- CUAGACUGAGGCUCCUUGAGG -56
Get sequence
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