MirGeneDB ID | Mmu-Mir-151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-151 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CGAGGAG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-151 Cfa-Mir-151 Cja-Mir-151 Cpo-Mir-151 Dno-Mir-151 Eca-Mir-151 Ete-Mir-151 Hsa-Mir-151 Laf-Mir-151 Mml-Mir-151 Mmr-Mir-151 Ocu-Mir-151 Pab-Mir-151 Rno-Mir-151 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr15: 73254820-73254875 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAGCACAGAUGAUGGAGCGCUUUCCUGCCCUCGAGGAGCUCACAGUCUAGUAUGUCUCCUCCCUACUAGACUGAGGCUCCUUGAGGACAGGGAUCGUCAUACUCACCUCCUGCCAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GAGCACAGAUGAUGGAG---| CU C CA UGUCU CG UUCCUG CCUCGAGGAGCU CAGUCUAGUA \ GC AGGGAC GGAGUUCCUCGG GUCAGAUCAU C GACCGUCCUCCACUCAUACU^ U- A A- CCCUC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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Comment | The highest expression of the 3p arm has a 1 nt addition of an "A." However when seen the 3' offset reads suggests that this is the correct Drosha cut. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-151_5p |
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mirBase accession | MIMAT0004536 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCGAGGAGCUCACAGUCUAGUA -22
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004536 TargetScanVert: mmu-miR-151-5p miRDB: MIMAT0004536 |
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Co-mature sequence | Mmu-Mir-151_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000161 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- CUAGACUGAGGCUCCUUGAGG -56
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000161 TargetScanVert: mmu-miR-151-3p miRDB: MIMAT0000161 |