MirGeneDB ID | Cfa-Mir-676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-676 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CGUCCUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | cfa-mir-676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-676 Cpo-Mir-676 Dno-Mir-676 Eca-Mir-676 Hsa-Mir-676 Laf-Mir-676 Mml-Mir-676 Mmr-Mir-676 Mmu-Mir-676 Ocu-Mir-676 Pab-Mir-676 Rno-Mir-676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (canFam3_add) |
chrX: 54495387-54495443 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUCAUAUCAGUUCUUCACCUGAAUGCAUGACUCUUCAAUCUCAGGACUCGCAGAAUUAAUGGAAUGCCGUCCUAAGGUUGGUGAGUUCUGCGUUUAUGGGCAUUUCAUCCCUAUGAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUCAUAUCAGUUCUUCA- -| U U C UC GAAUU CC UGAAUGCA GACUC UCAAUCU AGGAC GCA A GG AUUUGCGU UUGAG GGUUGGA UCCUG CGU A AAGUAUCCCUACUUUACG U^ C U A C- AAGGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cfa-Mir-676_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0006762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUCUUCAAUCUCAGGACUCGCA -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-676 miRDB: MIMAT0006762 |
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Mature sequence | Cfa-Mir-676_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- CCGUCCUAAGGUUGGUGAGUU -57
Get sequence
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