MirGeneDB ID | Cja-Mir-676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-676 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CGUCCUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | White-tufted-ear marmoset (Callithrix jacchus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-676 Cpo-Mir-676 Dno-Mir-676 Eca-Mir-676 Hsa-Mir-676 Laf-Mir-676 Mml-Mir-676 Mmr-Mir-676 Mmu-Mir-676 Ocu-Mir-676 Pab-Mir-676 Rno-Mir-676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_011100555.2_mCalJa1.2.pat.X_genomic) |
CM021937.1: 64195949-64196005 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUCAUAUCAGAUCCUCACCUGAAUGCAUGACUCUUCAACCUCAGGACUUGCAGAAUUAGUGGAAUGCCGUCCUAAGGUUGUUGAGUUGUGCAUUUGUGGGCAUUUCAUCUCUAUGGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUCAUAUCAGAUCCUCA- -| UG UU C UU GAAUU CC UGAAUGCA ACUC CAACCU AGGAC GCA A GG GUUUACGU UGAG GUUGGA UCCUG CGU G AGGUAUCUCUACUUUACG U^ GU UU A C- AAGGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Cja-Mir-676_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUCUUCAACCUCAGGACUUGCA -22
Get sequence
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Mature sequence | Cja-Mir-676_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- CCGUCCUAAGGUUGUUGAGUU -57
Get sequence
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