MirGeneDB ID | Pab-Mir-676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-676 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CGUCCUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Sumatran orangutan (Pongo abelii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-676 Cja-Mir-676 Cpo-Mir-676 Dno-Mir-676 Eca-Mir-676 Hsa-Mir-676 Laf-Mir-676 Mml-Mir-676 Mmr-Mir-676 Mmu-Mir-676 Ocu-Mir-676 Rno-Mir-676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_028885655.2_NHGRI_mPonAbe1-v2.0_traces) |
CM054702.2: 74854169-74854225 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUCAUAUCAGAUUCUCACCUGAACGCAUGACUCUUCAACCUCAGGACUUGCAGAAUUGAUGGAAUGCCGUCCUAAGGUUGUUGAGUUGUGCGUUUCUGGGCAUUUCAUCUCUAUGGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UUCAUAUCAGAUUCUCA- U-| UG UU C UU GAAUU CC GAACGCA ACUC CAACCU AGGAC GCA G GG UUUGCGU UGAG GUUGGA UCCUG CGU A AGGUAUCUCUACUUUACG UC^ GU UU A C- AAGGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Pab-Mir-676_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUCUUCAACCUCAGGACUUGCA -22
Get sequence
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Mature sequence | Pab-Mir-676_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- CCGUCCUAAGGUUGUUGAGUU -57
Get sequence
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