| MirGeneDB ID | Cfa-Mir-769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-769 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Dog (Canis familiaris) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | cfa-mir-769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-769 Cja-Mir-769 Cpo-Mir-769 Dno-Mir-769 Eca-Mir-769-P4 Eca-Mir-769-P5 Ete-Mir-769 Hsa-Mir-769 Laf-Mir-769-P1 Laf-Mir-769-P2 Laf-Mir-769-P3 Mml-Mir-769 Mmr-Mir-769 Pab-Mir-769 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (canFam3_add) |
chr1: 109618366-109618426 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGACCUGGUGCUGAUUCCUGCGCUCUGACCUGAGACCUCUGGGUUCUGAGCUGUGAUGUUCCUUCCAAGCUGGGAUCUCUGGGGUCUUGGUUCAGGGUCGGGGCCUCUGGGUUAUGAGCACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UGACCUGGUGCUGAUUC- G -| C UG U U G GUGAUGU CU CG CUCUGA C AGACCUC GGG UCU AGCU \ GG GC GGGACU G UCUGGGG CUC AGG UCGA U CACGAGUAUUGGGUCUCC G U^ U GU U U G ACCUUCC . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| Comment | There is a second Dicer cut -1 on both arms. Although the 3' terminal uridine is templated the DcRNA reads in human suggest that this is a Group 2 miRNA. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Cfa-Mir-769_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGACCUCUGGGUUCUGAGCU -22
Get sequence
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| Star sequence | Cfa-Mir-769_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0034400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- CUGGGAUCUCUGGGGUCUUGGU -61
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: cfa-miR-769 miRDB: MIMAT0034400 |
