MirGeneDB ID | Dme-Mir-67-v3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAACCUC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila melanogaster) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dme-mir-307a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dme-Mir-67-v1 Dme-Mir-67-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cte-Mir-67 Dgr-Mir-67 Dma-Mir-67 Dpu-Mir-67 Dsi-Mir-67-v3 Dya-Mir-67-v3 Egr-Mir-67 Gsa-Mir-67 Hru-Mir-67 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ofu-Mir-67 Ovu-Mir-67 Pau-Mir-67 Pca-Mir-67 Pdu-Mir-67 Sma-Mir-67 Sme-Mir-67 Snu-Mir-67 Tca-Mir-67-v3 Tur-Mir-67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_melanogaster_BDGP6) |
2R: 9621261-9621326 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-v3) |
Mir-67-v1
2R: 9621261-9621326 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-67-v2 2R: 9621261-9621326 [-] UCSC Ensembl Mir-67-v3 2R: 9621261-9621326 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCAAAGUUAGCAGCAUUUUGUCUUGCUUUGACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGUUAUUUCGAUAUGGUAUCCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGAUAGCAGGACAGAGUAUCCACGAAACUAACUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GCAAAGUUAGCAGCAUU-- -| A CCU G UGUUAUUUCG UUGUCUUGCU UUG CUCACUCAA GG UGUGA A GACAGGACGA AGC GAGUGAGUU CC ACACU U UCAAUCAAAGCACCUAUGA U^ - CCU A ACCUAUGGUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dme-Mir-67-v3_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0020832 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGA -21
Get sequence
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Mature sequence | Dme-Mir-67-v3_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
45- ACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -66
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000398 TargetScanFly: dme-miR-307 |