MirGeneDB ID | Dno-Mir-885 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-885 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CCAUUAC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dno-mir-885 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-885 Cfa-Mir-885 Cja-Mir-885 Eca-Mir-885 Hsa-Mir-885 Laf-Mir-885 Mml-Mir-885 Mmr-Mir-885 Ocu-Mir-885 Pab-Mir-885 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (dasNov3) |
JH570235: 996212-996265 [+] UCSC Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCCCAAGGCUGCCGCUCGGCCCACACUCUCUCCAUUACACUACCCUGCCUCUUCUCCACGAGAGGCAGCUGGGUGUAGCGGAUAGAGCACGGGUUCAAGUCCCAGCUCCACCGCGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GCCCAAGGCUGCCGCUC--| ACA C A ACC UCU GGCCC CUCU UCC UUACACU CUGCCUCU C UUGGG GAGA AGG GAUGUGG GACGGAGA C CGCCACCUCGACCCUGAAC^ CAC U C GUC GCA 110 100 90 80 70 60 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Dno-Mir-885_5p |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0048020 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCCAUUACACUACCCUGCCUCU -22
Get sequence
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Dno-Mir-885_3p* (predicted) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0048021 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
32- AGGCAGCUGGGUGUAGCGGAUA -54
Get sequence
|