MirGeneDB ID | Eca-Mir-459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-459 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAGUAAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Horse (Equus caballus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | eca-mir-802 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Ami-Mir-459 Bta-Mir-459 Cfa-Mir-459 Cja-Mir-459 Cli-Mir-459 Cpi-Mir-459 Cpo-Mir-459 Dno-Mir-459 Dre-Mir-459 Ebu-Mir-459 Ete-Mir-459 Gmo-Mir-459 Hsa-Mir-459 Laf-Mir-459 Loc-Mir-459 Mal-Mir-459 Mml-Mir-459 Mmr-Mir-459 Mmu-Mir-459 Mun-Mir-459 Oan-Mir-459 Ocu-Mir-459 Pab-Mir-459 Pma-Mir-459 Rno-Mir-459 Spt-Mir-459 Sto-Mir-459 Tni-Mir-459 Xla-Mir-459-P1 Xla-Mir-459-P2 Xtr-Mir-459 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_002863925.1_EquCab3.0) |
CM009173.1: 33335417-33335477 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGAUCACCAUCAGACUUCUAUUAUUUGCAAUCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGUGUCCAUCAAGCAACAAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGUGUAAUUAAUAGCUGCGCUUCGCGUGGGAAGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UGAUCACCAUCAGACUU--| U AUC A A GUCCA CUAUUA UUGCA AGU ACAAAGAUUC UCCUUGU U GAUAAU AAUGU UCA UGUUUCUAAG AGGAACA C GAAGGGUGCGCUUCGCGUC^ U GAU C - ACGAA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Eca-Mir-459_5p |
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mirBase accession | MIMAT0013183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCAGUAACAAAGAUUCAUCCUUGU -24
Get sequence
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Star sequence | Eca-Mir-459_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
38- AAGGAGAAUCUUUGUCACUUAGU -61
Get sequence
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