MirGeneDB ID | Hsa-Mir-770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-770 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CCAGUAC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-770 Eca-Mir-770 Mml-Mir-770 Mmr-Mir-770 Mmu-Mir-770 Pab-Mir-770 Rno-Mir-770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Euarchontoglires | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Boreoeutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr14: 100852409-100852470 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-770) |
Mir-770
chr14: 100852409-100852470 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-493 chr14: 100869075-100869136 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v1 chr14: 100874515-100874574 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 chr14: 100874515-100874574 [+] UCSC Ensembl Mir-431 chr14: 100881026-100881089 [+] UCSC Ensembl Mir-433 chr14: 100881897-100881970 [+] UCSC Ensembl Mir-127 chr14: 100883001-100883056 [+] UCSC Ensembl Mir-432 chr14: 100884496-100884564 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 chr14: 100884716-100884771 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 chr14: 100884716-100884771 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AUUCAUGUGUCAGGAGCCACCUUCCGAGCCUCCAGUACCACGUGUCAGGGCCACAUGAGCUGGGCCUCGUGGGCCUGAUGUGGUGCUGGGGCCUCAGGGGUCUGCUCUUCUUCUCUUUCAGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AUUCAUGUGUCAGGAGCC---| CC C GU G AUGAGC ACCUU GAG CUCCAGUACCAC GUCAGG CCAC U UGGGG CUC GGGGUCGUGGUG UAGUCC GGUG G AGACUUUCUCUUCUUCUCGUC^ A- C -- G CUCCGG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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Comment | The Drosha cut is -3 relative to the murids and Microcebus. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-770_5p |
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mirBase accession | MIMAT0003948 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCCAGUACCACGUGUCAGGGCCACA -25
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003948 TargetScanVert: hsa-miR-770-5p TargetMiner: hsa-miR-770-5p miRDB: MIMAT0003948 |
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Star sequence | Hsa-Mir-770_3p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- UGGGCCUGAUGUGGUGCUGGGGC -62
Get sequence
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