MirGeneDB ID | Hsa-Mir-431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-431 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GUCUUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-431 Cfa-Mir-431 Cja-Mir-431 Cpo-Mir-431 Eca-Mir-431 Ete-Mir-431 Laf-Mir-431 Mml-Mir-431 Mmr-Mir-431 Mmu-Mir-431 Ocu-Mir-431 Pab-Mir-431 Rno-Mir-431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr14: 100881026-100881089 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-431) |
Mir-770
chr14: 100852409-100852470 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-493 chr14: 100869075-100869136 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v1 chr14: 100874515-100874574 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 chr14: 100874515-100874574 [+] UCSC Ensembl Mir-431 chr14: 100881026-100881089 [+] UCSC Ensembl Mir-433 chr14: 100881897-100881970 [+] UCSC Ensembl Mir-127 chr14: 100883001-100883056 [+] UCSC Ensembl Mir-432 chr14: 100884496-100884564 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 chr14: 100884716-100884771 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 chr14: 100884716-100884771 [+] UCSC Ensembl Mir-370 chr14: 100911151-100911207 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCACGUCGUUGUCCUGCUUGUCCUGCGAGGUGUCUUGCAGGCCGUCAUGCAGGCCACACUGACGGUAACGUUGCAGGUCGUCUUGCAGGGCUUCUCGCAAGACGACAUCCUCAUCACCAACGACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GCACGUCGUUGUCCUGC--| C U C UCA GGCCACACU UUGUC UGCGAGG GUCUUGCAGG CG UGCA G AGCAG ACGCUCU CGGGACGUUC GC ACGU A CAGCAACCACUACUCCUAC^ A U U UGG UGCAAUGGC 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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Comment | There are multiple Dicer cuts ranging from +1 to +3 on both arms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-431_5p |
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mirBase accession | MIMAT0001625 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UGUCUUGCAGGCCGUCAUGCA -21
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0001625 TargetScanVert: hsa-miR-431-5p TargetMiner: hsa-miR-431-5p miRDB: MIMAT0001625 |
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Co-mature sequence | Hsa-Mir-431_3p |
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mirBase accession | MIMAT0004757 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
43- CAGGUCGUCUUGCAGGGCUUC -64
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004757 TargetScanVert: hsa-miR-431-3p TargetMiner: hsa-miR-431-3p miRDB: MIMAT0004757 |