MirGeneDB ID | Hsa-Mir-127 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-127 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CGGAUCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-127 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-127 Cfa-Mir-127 Cja-Mir-127 Cpo-Mir-127 Dno-Mir-127 Eca-Mir-127 Ete-Mir-127 Laf-Mir-127 Mml-Mir-127 Mmr-Mir-127 Mmu-Mir-127 Ocu-Mir-127 Pab-Mir-127 Rno-Mir-127 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr14: 100883001-100883056 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-127) |
Mir-770
chr14: 100852409-100852470 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-493 chr14: 100869075-100869136 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v1 chr14: 100874515-100874574 [+] UCSC Ensembl Mir-337-v2 chr14: 100874515-100874574 [+] UCSC Ensembl Mir-431 chr14: 100881026-100881089 [+] UCSC Ensembl Mir-433 chr14: 100881897-100881970 [+] UCSC Ensembl Mir-127 chr14: 100883001-100883056 [+] UCSC Ensembl Mir-432 chr14: 100884496-100884564 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v2 chr14: 100884716-100884771 [+] UCSC Ensembl Mir-136-v1 chr14: 100884716-100884771 [+] UCSC Ensembl Mir-370 chr14: 100911151-100911207 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGUCUCGCUGUGAUCACUGUCUCCAGCCUGCUGAAGCUCAGAGGGCUCUGAUUCAGAAAGAUCAUCGGAUCCGUCUGAGCUUGGCUGGUCGGAAGUCUCAUCAUCUGCUUCCUUCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GGUCUCGCUGUGAUCACUGUC--| A U G G C UCAGA UCC GCC GCU AAGCUCAGA GG UCUGAU \ AGG UGG CGG UUCGAGUCU CC AGGCUA A GCUUCCUUCGUCUACUACUCUGA^ C U - G U CUAGA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Hsa-Mir-127_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0004604 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CUGAAGCUCAGAGGGCUCUGAUU -23
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004604 TargetScanVert: hsa-miR-127-5p TargetMiner: hsa-miR-127-5p miRDB: MIMAT0004604 |
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Mature sequence | Hsa-Mir-127_3p |
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mirBase accession | MIMAT0000446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
34- UCGGAUCCGUCUGAGCUUGGCU -56
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000446 TargetScanVert: hsa-miR-127-3p TargetMiner: hsa-miR-127-3p miRDB: MIMAT0000446 |