MirGeneDB ID | Mmr-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-374 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAUAAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmr-mir-374a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-374-P1 Cfa-Mir-374-P1 Cja-Mir-374-P1 Cpo-Mir-374-P1 Dno-Mir-374-P1 Eca-Mir-374-P1 Hsa-Mir-374-P1 Mml-Mir-374-P1 Ocu-Mir-374-P1 Pab-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007685.1: 9645350-9645401 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACCCCCUGGAAGGAAAUUUUACAUCGGCCAUUAUAAUACAACCUGAUAAGUGUUUGAACACUUAUCAGAUUGUAUUGUAAUUGUCUGUGUAUAUAUGCCUGUCUCUCUUCCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 ACCCCCUGGAAGGAAAUUU--| C C C UU UACAU GGC AUUAUAAUACAA CUGAUAAGUG U AUGUG CUG UAAUGUUAUGUU GACUAUUCAC G UCCUUCUCUCUGUCCGUAUAU^ U U A AA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmr-Mir-374-P1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0049164 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG -22
Get sequence
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Star sequence | Mmr-Mir-374-P1_3p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
30- CUUAUCAGAUUGUAUUGUAAUU -52
Get sequence
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