MirGeneDB ID | Bta-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-374 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAUAAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Cow (Bos taurus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | bta-mir-374a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Bta-Mir-374-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cfa-Mir-374-P1 Cja-Mir-374-P1 Cpo-Mir-374-P1 Dno-Mir-374-P1 Eca-Mir-374-P1 Hsa-Mir-374-P1 Mml-Mir-374-P1 Mmr-Mir-374-P1 Ocu-Mir-374-P1 Pab-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_002263795.1_ARS-UCD1.2_BTA) |
NC_037357.1: 76853059-76853110 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-374-P1) |
Mir-374-P1
NC_037357.1: 76853059-76853110 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-421-P1-v1 NC_037357.1: 76853220-76853282 [+] UCSC Ensembl Mir-421-P1-v2 NC_037357.1: 76853222-76853281 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCCCCCUGGAAAUGAAUUUUACAUCGGCCAUUAUAAUACAACCUGAUAAGUGUUACAGCACUUAUCAGGUUGUAUUGUAAUUGUCUGUGUAUAUGCCUGUCUCCCUUCCUUUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GCCCCCUGGAAAUGAAUUU--| C C UU UACAU GGC AUUAUAAUACAACCUGAUAAGUG A AUGUG CUG UAAUGUUAUGUUGGACUAUUCAC C UUUCCUUCCCUCUGUCCGUAU^ U U GA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Bta-Mir-374-P1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0004342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: bta-miR-374a |
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Co-mature sequence | Bta-Mir-374-P1_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
30- CUUAUCAGGUUGUAUUGUAAUU -52
Get sequence
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