MirGeneDB ID | Mml-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-374 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UAUAAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Rhesus monkey (Macaca mulatta) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mml-mir-374a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mml-Mir-374-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-374-P1 Cfa-Mir-374-P1 Cja-Mir-374-P1 Cpo-Mir-374-P1 Dno-Mir-374-P1 Eca-Mir-374-P1 Hsa-Mir-374-P1 Mmr-Mir-374-P1 Ocu-Mir-374-P1 Pab-Mir-374-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_003339765.3_Mmul_10_traces) |
CM014356.1: 71376622-71376673 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-374-P1) |
Mir-421-P1-v1
CM014356.1: 71376450-71376512 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-421-P1-v2 CM014356.1: 71376451-71376510 [-] UCSC Ensembl Mir-374-P1 CM014356.1: 71376622-71376673 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACCCUCUGGGAAGAAAUUUUACAUCGGCCAUUAUAAUACAACCUGAUAAGUGUUACAGCACUUAUCAGAUUGUAUUGUAAUUGUCUGUGUAUGUAUGCCUGUCUCUCUUCCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 ACCCUCUGGGAAGAAAUUU--| C C C UU UACAU GGC AUUAUAAUACAA CUGAUAAGUG A AUGUG CUG UAAUGUUAUGUU GACUAUUCAC C UCCUUCUCUCUGUCCGUAUGU^ U U A GA 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mml-Mir-374-P1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0006300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG -22
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-374a-5p |
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Co-mature sequence | Mml-Mir-374-P1_3p |
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mirBase accession | MIMAT0026859 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
30- CUUAUCAGAUUGUAUUGUAAUU -52
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mml-miR-374a-3p |