MirGeneDB ID | Mmu-Mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-760 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGCUCUG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-760 Cja-Mir-760 Cpo-Mir-760 Dno-Mir-760 Eca-Mir-760 Ete-Mir-760 Hsa-Mir-760 Laf-Mir-760 Mml-Mir-760 Mmr-Mir-760 Ocu-Mir-760 Pab-Mir-760 Rno-Mir-760 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr3: 122293614-122293671 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GGAGGAUGCCUCGGUGCGGGGCGCGUCGCCCCCCUCAGGCCACCAGAGCCCGGAUACCUCAGAAAUUCGGCUCUGGGUCUGUGGGGAGCGAAAUGCAACCCAAACCCCGUUUCCCCGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 GGAGGAUGCCUCGGUGC- G-| CG C U AC C UACCU GG GCG UCGC CCCC CAGGCC CAGAGCC GGA \ CC CGU AGCG GGGG GUCUGG GUCUCGG CUU C AGCCCCUUUGCCCCAAAC AA^ AA A U -- - AAAGA 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | Yes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmu-Mir-760_5p* |
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mirBase accession | MIMAT0017245 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCCCUCAGGCCACCAGAGCCCGGA -24
Get sequence
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Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-760-5p miRDB: MIMAT0017245 |
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Mature sequence | Mmu-Mir-760_3p |
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mirBase accession | MIMAT0003898 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- CGGCUCUGGGUCUGUGGGGAG -58
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003898 TargetScanVert: mmu-miR-760-3p miRDB: MIMAT0003898 |