| MirGeneDB ID | Pbv-Mir-146-P2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-146 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAGAACU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Burmese python (Python bivittatus) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | pbv-mir-146b | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Pbv-Mir-146-P1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-146-P2 Ami-Mir-146-P2 Cli-Mir-146-P2 Cmi-Mir-146-P2 Cpi-Mir-146-P2 Ebu-Mir-146 Gga-Mir-146-P2 Gja-Mir-146-P2 Lch-Mir-146-P2 Mun-Mir-146-P2-v1 Mun-Mir-146-P2-v2 Pma-Mir-146 Spt-Mir-146-P2 Sto-Mir-146-P2 Tgu-Mir-146-P2 Xla-Mir-146-P2a Xla-Mir-146-P2b Xtr-Mir-146-P2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000186305.2_Python_molurus_bivittatus) |
KE960809.1: 20193-20257 [-] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGAAGAUGAGACUCUGGCAGUCCCAGGCUCUGAGAACUGGUUUUGAUGGACUAGUUUCCUUUCAGUUUUUUCAGUCCAUAAUAUCCAGUUCUCUAGCUUGGCUGCAUCUGACUUCAUAACUAAGGGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AGAAGAUGAGACUCUGG----| UC CU UUUUG AGUUUCCUU CAG CCAGGCU GAGAACUGG AUGGACU U GUC GGUUCGA CUCUUGACC UACCUGA C GGAAUCAAUACUUCAGUCUAC^ -- U- UAUAA CUUUUUUGA 120 110 100 90 80 70 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Pbv-Mir-146-P2_5p (predicted) |
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| mirBase accession | MIMAT0038962 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UGAGAACUGGUUUUGAUGGACUA -23
Get sequence
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| Star sequence | Pbv-Mir-146-P2_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- GUCCAUAAUAUCCAGUUCUCUA -65
Get sequence
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