| MirGeneDB ID | Sha-Mir-430-o15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Sha-Mir-430-o10 Sha-Mir-430-o11 Sha-Mir-430-o12 Sha-Mir-430-o13 Sha-Mir-430-o14 Sha-Mir-430-o16 Sha-Mir-430-o17 Sha-Mir-430-o18 Sha-Mir-430-o19 Sha-Mir-430-o20 Sha-Mir-430-o21 Sha-Mir-430-o22 Sha-Mir-430-o23 Sha-Mir-430-o24 Sha-Mir-430-o25 Sha-Mir-430-o26 Sha-Mir-430-o27 Sha-Mir-430-o29 Sha-Mir-430-P1 Sha-Mir-430-P2 Sha-Mir-430-P3 Sha-Mir-430-P51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Hsa-Mir-430-P15 Mml-Mir-430-P15 Pab-Mir-430-P15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | S. harrisii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (DEVIL_add) |
GL850554.1: 11170-11227 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUUCAAGAUAAGACUAGUCUCUUCUGACACACCCUAACUGAGGGCAUUUAUUGGAUAUAUGAAAAGAUAAGUGCUCUCUGUGGGGUGAGACAGGUUGAGAACUGACCUCGCCAUACUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUUCAAGAUAAGACUAG- U-| ACA ACU GGAUAU UCUC UCUG CACCCUA GAGGGCAUUUAUU \ AGAG GGAC GUGGGGU CUCUCGUGAAUAG A GUCAUACCGCUCCAGUCA UU^ AGA GU- AAAAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Sha-Mir-430-o15_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACCCUAACUGAGGGCAUUUAUU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Sha-Mir-430-o15_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
37- UAAGUGCUCUCUGUGGGGUGA -58
Get sequence
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