| MirGeneDB ID | Sha-Mir-430-o12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tasmanian devil (Sarcophilus harrisii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Sha-Mir-430-o10 Sha-Mir-430-o11 Sha-Mir-430-o13 Sha-Mir-430-o14 Sha-Mir-430-o15 Sha-Mir-430-o16 Sha-Mir-430-o17 Sha-Mir-430-o18 Sha-Mir-430-o19 Sha-Mir-430-o20 Sha-Mir-430-o21 Sha-Mir-430-o22 Sha-Mir-430-o23 Sha-Mir-430-o24 Sha-Mir-430-o25 Sha-Mir-430-o26 Sha-Mir-430-o27 Sha-Mir-430-o29 Sha-Mir-430-P1 Sha-Mir-430-P2 Sha-Mir-430-P3 Sha-Mir-430-P51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Hsa-Mir-430-P12a Hsa-Mir-430-P12b Mml-Mir-430-P12c Mml-Mir-430-P12d Mml-Mir-430-P12e Pab-Mir-430-P12a Pab-Mir-430-P12b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | S. harrisii | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (DEVIL_add) |
GL850554.1: 9594-9645 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGUAAUUAUCAGUACAACCCAGCCUUGGACAUCCUAAUGCAGAGCACUUAUUGGAUGUCUUAAGUGCUUUCUGUUAGGAUAAGUCUGCUAGGAUCAAGCUCCUUAAGAUACUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AGUAAUUAUCAGUACAA---| C CUU -- C UUGG CC AGC GGAC AUCCUAAUG AGAGCACUUA A GG UCG UCUG UAGGAUUGU UUUCGUGAAU U UCAUAGAAUUCCUCGAACUA^ A --- AA C UCUG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Sha-Mir-430-o12_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUCCUAAUGCAGAGCACUUAUU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Sha-Mir-430-o12_3p (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
30- UAAGUGCUUUCUGUUAGGAUAA -52
Get sequence
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