MirGeneDB 2.1
MirGeneDB ID

Sto-Let-7-P1b

Family name LET-7 (all species)
Seed GAGGUAG
Species Cloudy Catshark (Scyliorhinus torazame)
MiRBase ID
Paralogues Sto-Let-7-P1c  Sto-Let-7-P1d  Sto-Let-7-P2a1  Sto-Let-7-P2a2  Sto-Let-7-P2a3  Sto-Let-7-P2b2  Sto-Let-7-P2b3  Sto-Let-7-P2c1  Sto-Let-7-P2c2  Sto-Let-7-P2c3 
Orthologues Aae-Let-7  Aca-Let-7-P1b  Ami-Let-7-P1b  Bge-Let-7  Bpl-Let-7  Bta-Let-7-P1b  Cfa-Let-7-P1b  Cgi-Let-7  Cin-Let-7-P1  Cpi-Let-7-P1b  Cpo-Let-7-P1b  Cte-Let-7  Dan-Let-7  Dma-Let-7  Dme-Let-7  Dmo-Let-7  Dpu-Let-7  Dre-Let-7-P1b1  Dre-Let-7-P1b2  Dsi-Let-7  Dya-Let-7  Esc-Let-7  Ete-Let-7-P1b  Gja-Let-7-P1b  Gmo-Let-7-P1b1  Gmo-Let-7-P1b2  Hme-Let-7  Hsa-Let-7-P1b  Isc-Let-7  Lan-Let-7  Lch-Let-7-P1b  Lgi-Let-7  Loc-Let-7-P1b  Mal-Let-7-P1b1  Mal-Let-7-P1b2  Mdo-Let-7-P1b  Mml-Let-7-P1b  Mmu-Let-7-P1b  Mun-Let-7-P1b  Npo-Let-7  Oan-Let-7-P1b  Obi-Let-7  Ocu-Let-7-P1b  Ovu-Let-7  Pbv-Let-7-P1b  Pfl-Let-7  Pmi-Let-7  Rno-Let-7-P1b  Sha-Let-7-P1b  Sko-Let-7  Spt-Let-7-P1b  Spu-Let-7  Tca-Let-7  Tni-Let-7-P1b1  Tni-Let-7-P1b2  Xbo-Let-7  Xla-Let-7-P1b3  Xla-Let-7-P1b4  Xtr-Let-7-P1b 
Node of Origin (locus) Gnathostomata
Node of Origin (family) Bilateria
Genome context
(GCA_003427355_STO_add)		 BFAA01007834.1: 15484-15550 [-]
Precursor
(pre-Mir +30nt flank)
AGUGCCAUCAGCCAGUCGUGGGCCUCGGGGUGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUUCAGAGUAACAUCACAGGAGAUAGCUGUACAAUCUUCUAGCUUUCCCUGAGGACCCCACACUCUCGACCGCCCCUC
Get precursor sequence
Structure
        10         20         30        40        50        60   
AGUGCCAUCAGCCAGUCGU-   -|       U   G   U             CAGAGUAACA 
                    GGG CCUCGGGG GAG UAG AGGUUGUAUAGUU          \
                    CCC GGAGUCCC UUC AUC UCUAACAUGUCGA          U
CUCCCCGCCAGCUCUCACAC   A^       U   G   U             UAGAGGACAC 
     120       110       100        90        80        70
Deep sequencing
Go to detailed chart
3' NTU No
MotifsNo
Tissue expression
-   +
To
Mature sequence

Sto-Let-7-P1b_5p
mirBase accessionNone
Sequence 
0- UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU -22
Get sequence
Star sequence

Sto-Let-7-P1b_3p*
mirBase accessionNone
Sequence 
45- CUGUACAAUCUUCUAGCUUUCC -67
Get sequence