MirGeneDB 3.0
42 microRNA genes with node of origin R. norvegicus
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID ▲ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Rno-Mir-15-P1c3 rno-mir-322-1 MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001619 MIMAT0000547 chrX 158584564 158584621 + R. norvegicus Olfactores No
Rno-Mir-15-P1c4 rno-mir-322-2 MIR-15 AGCAGCA MIMAT0001619 MIMAT0000547 chrX 158148183 158148240 + R. norvegicus Olfactores No
Rno-Mir-15-P2c3 rno-mir-503-1 MIR-15 AGCAGCG MIMAT0003213 MIMAT0017224 chrX 158584862 158584924 + R. norvegicus Olfactores No 1
Rno-Mir-15-P2c4 rno-mir-503-2 MIR-15 AGCAGCG MIMAT0003213 MIMAT0017224 chrX 158148481 158148543 + R. norvegicus Olfactores No 1
Rno-Mir-29-P1d5-v1 rno-mir-29b-2 MIR-29 AGCACCA MIMAT0004717 MIMAT0000801 chr13 113782066 113782130 + R. norvegicus Bilateria No 1
Rno-Mir-29-P1d5-v2 rno-mir-29b-3 MIR-29 UAGCACC MIMAT0004717 MIMAT0000801 chr13 113782067 113782129 + R. norvegicus Bilateria No 1
Rno-Mir-29-P1d6-v1 rno-mir-29b-2 MIR-29 AGCACCA MIMAT0004717 MIMAT0000801 chr1 38238385 38238449 + R. norvegicus Bilateria No 1
Rno-Mir-29-P1d6-v2 rno-mir-29b-3 MIR-29 UAGCACC MIMAT0004717 MIMAT0000801 chr1 38238386 38238448 + R. norvegicus Bilateria No 1
Rno-Mir-29-P2d5 rno-mir-29c-1 MIR-29 AGCACCA MIMAT0003154 MIMAT0000803 chr13 113782602 113782659 + R. norvegicus Bilateria No 1
Rno-Mir-29-P2d6 rno-mir-29c-2 MIR-29 AGCACCA MIMAT0003154 MIMAT0000803 chr1 38238921 38238978 + R. norvegicus Bilateria No 1
Rno-Mir-190-P1c rno-mir-190a-1 MIR-190 GAUAUGU MIMAT0000865 MIMAT0017145 chr8 80928179 80928237 + R. norvegicus Bilateria No 1 1
Rno-Mir-190-P1d rno-mir-190a-2 MIR-190 GAUAUGU MIMAT0000865 MIMAT0017145 chr8 73030059 73030117 - R. norvegicus Bilateria No 1 1
Rno-Mir-196-P1c rno-mir-196b-1 MIR-196 AGGUAGU MIMAT0001082 MIMAT0017171 chr4 82284863 82284920 - R. norvegicus Olfactores No 1
Rno-Mir-196-P1d rno-mir-196b-2 MIR-196 AGGUAGU MIMAT0001082 MIMAT0017171 chr4 82199068 82199125 - R. norvegicus Olfactores No 1
Rno-Mir-340-P1 rno-mir-340-1 MIR-340 UAUAAAG MIMAT0004650 MIMAT0000585 chr10 35559001 35559065 + R. norvegicus Eutheria No 1 1
Rno-Mir-340-P2 rno-mir-340-2 MIR-340 UAUAAAG MIMAT0004650 MIMAT0000585 chr10 35571773 35571837 + R. norvegicus Eutheria No 1 1
Rno-Mir-350-P1 rno-mir-350-1 MIR-350 AAGUGCA None MIMAT0000604 chr13 43827515 43827575 + R. norvegicus Eutheria No 1 1
Rno-Mir-350-P2 rno-mir-350-2 MIR-350 AAGUGCA None MIMAT0000604 chr13 94849831 94849891 - R. norvegicus Eutheria No 1 1
Rno-Mir-351-P1a rno-mir-351-1 MIR-351 CCCUGAG MIMAT0000608 MIMAT0017041 chrX 158585602 158585661 + R. norvegicus Muridae No 1
Rno-Mir-351-P1b rno-mir-351-2 MIR-351 CCCUGAG MIMAT0000608 MIMAT0017041 chrX 158149221 158149280 + R. norvegicus Muridae No 1
Rno-Mir-430-P6a rno-mir-295-1 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0012849 MIMAT0017366 chr1 66133322 66133380 - R. norvegicus Vertebrata No
Rno-Mir-430-P6b rno-mir-295-2 MIR-430 AAGUGCU MIMAT0012849 MIMAT0017366 chr1 64536633 64536691 - R. norvegicus Vertebrata No
Rno-Mir-450-P1a rno-mir-450b-1 MIR-450 UUUGCGA MIMAT0035746 MIMAT0035747 chrX 158589644 158589700 + R. norvegicus Eutheria No 1
Rno-Mir-450-P1b rno-mir-450b-2 MIR-450 UUUGCGA MIMAT0035746 MIMAT0035747 chrX 158153261 158153317 + R. norvegicus Eutheria No 1
Rno-Mir-450-P2a None MIR-450 UUGGGAA None None chrX 158589777 158589833 + R. norvegicus Eutheria No 1
Rno-Mir-450-P2b rno-mir-450a MIR-450 UUUGCGA MIMAT0001547 MIMAT0017183 chrX 158153394 158153450 + R. norvegicus Eutheria No 1
Rno-Mir-450-P3a None MIR-450 UUUGCAG None None chrX 158589938 158589994 + R. norvegicus Eutheria Unknown
Rno-Mir-450-P3b None MIR-450 UUUGCAG None None chrX 158153555 158153611 + R. norvegicus Eutheria Unknown
Rno-Mir-506-P25 rno-mir-3551 MIR-506 CUUCACC MIMAT0017809 MIMAT0017810 chrX 151272836 151272891 - R. norvegicus Eutheria No
Rno-Mir-542-P1a rno-mir-542-1 MIR-542 GUGACAG MIMAT0003178 MIMAT0003179 chrX 158588539 158588599 + R. norvegicus Eutheria No 1
Rno-Mir-542-P1b rno-mir-542-3 MIR-542 GUGACAG MIMAT0003178 MIMAT0003179 chrX 158158895 158158955 + R. norvegicus Eutheria No 1
Rno-Mir-542-P1c rno-mir-542-2 MIR-542 GUGACAG MIMAT0003178 MIMAT0003179 chrX 158152156 158152216 + R. norvegicus Eutheria No 1
Rno-Mir-598-P1 rno-mir-598-1 MIR-598 ACGUCAU MIMAT0005324 MIMAT0005325 chr15 47057506 47057564 + R. norvegicus Eutheria No 1 1
Rno-Mir-598-P2 rno-mir-598-2 MIR-598 ACGUCAU MIMAT0005324 MIMAT0005325 chr15 46893167 46893225 + R. norvegicus Eutheria No 1 1
Rno-Mir-1962-P1 None MIR-1962 GAGGCUG None None chr1 207802815 207802877 + R. norvegicus Muridae Unknown 1
Rno-Mir-1962-P2 None MIR-1962 GAGGCUG None None chr1 207848066 207848128 + R. norvegicus Muridae Unknown 1
Rno-Mir-3558 rno-mir-3558 MIR-3558 CAUAGAA MIMAT0017825 MIMAT0017826 chr6 10992716 10992779 + R. norvegicus R. norvegicus No
Rno-Mir-3559 rno-mir-3559 MIR-3559 GACAGAC MIMAT0017827 MIMAT0017828 chrX 75459266 75459327 - R. norvegicus R. norvegicus No
Rno-Mir-3580 rno-mir-3580 MIR-3580 GACUAGG MIMAT0017868 MIMAT0017869 chrX 151295627 151295682 - R. norvegicus R. norvegicus No 1
Rno-Mir-3593 rno-mir-3593 MIR-3593 UUCAACC MIMAT0017896 MIMAT0017897 chr6 76661814 76661867 - R. norvegicus R. norvegicus No 1
Rno-Mir-6324 rno-mir-6324 MIR-6324 GCUCUGC None MIMAT0025063 chr11 36383558 36383621 - R. norvegicus R. norvegicus No 1
Rno-Mir-6329 rno-mir-6329 MIR-6329 AUGUGAC MIMAT0025068 None chr8 56629614 56629670 - R. norvegicus R. norvegicus No 1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all