MirGeneDB 2.1
82 microRNA genes with node of origin Neoptera
Sort by genome coordinates Motifs
MirGeneDB ID ▲ MiRBase ID Family Seed 5p accession 3p accession Chromosome Start End Strand Node of origin (locus) Node of origin (family) 3' NTU  UG  UGUG CNNC
Aae-Mir-2-P7 aae-mir-11 MIR-2 AUCACAG MIMAT0014241 MIMAT0014242 supercont1.744 322020 322083 + Neoptera Protostomia No 1
Bge-Mir-2-P7 None MIR-2 AUCACAG None None KZ614377.1 360106 360165 + Neoptera Protostomia No 1 1
Dan-Mir-2-P7 dan-mir-11 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008472 scaffold_13340 5675694 5675758 + Neoptera Protostomia No 1
Dme-Mir-2-P7 dme-mir-11 MIR-2 AUCACAG MIMAT0020793 MIMAT0000116 3R 21622503 21622563 - Neoptera Protostomia No 1
Dmo-Mir-2-P7 dmo-mir-11 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008679 scaffold_6540 1740130 1740196 - Neoptera Protostomia No 1 1
Dsi-Mir-2-P7 dsi-mir-11 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0008865 3R 3864432 3864492 + Neoptera Protostomia No 1
Dya-Mir-2-P7 dya-mir-11 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0009123 3R 6285780 6285840 - Neoptera Protostomia No 1
Hme-Mir-2-P7 hme-mir-11 MIR-2 AUCACAG None MIMAT0024934 HE672080 326757 326812 - Neoptera Protostomia No 1
Tca-Mir-2-P7 tca-mir-11 MIR-2 AUCACAG MIMAT0018854 MIMAT0018855 LG5 7197519 7197576 + Neoptera Protostomia No 1 1
Aae-Mir-14 aae-mir-14 MIR-14 CAGUCUU None MIMAT0014240 supercont1.249 1089019 1089083 - Neoptera Neoptera No 1
Bge-Mir-14 None MIR-14 CAGUCUU None None KZ617020.1 136664 136723 - Neoptera Neoptera No 1
Dan-Mir-14 dan-mir-14 MIR-14 CAGUCUU None MIMAT0008460 scaffold_13266 183971 184029 - Neoptera Neoptera No 1 1
Dme-Mir-14 dme-mir-14 MIR-14 CAGUCUU MIMAT0020798 MIMAT0000120 2R 9553765 9553823 + Neoptera Neoptera No 1 1
Dmo-Mir-14 dmo-mir-14 MIR-14 CAGUCUU None MIMAT0008632 scaffold_6496 2042860 2042918 + Neoptera Neoptera No 1 1
Dsi-Mir-14 dsi-mir-14 MIR-14 CAGUCUU None MIMAT0008848 2R 6226266 6226324 + Neoptera Neoptera No 1 1
Dya-Mir-14 dya-mir-14 MIR-14 CAGUCUU None MIMAT0009076 2L 18072285 18072343 + Neoptera Neoptera No 1 1
Hme-Mir-14 hme-mir-14 MIR-14 CAGUCUU None MIMAT0024942 HE671256 64280 64336 + Neoptera Neoptera No
Tca-Mir-14 tca-mir-14 MIR-14 CAGUCUU MIMAT0019105 MIMAT0008361 LG3 2833776 2833833 + Neoptera Neoptera No 1
Aae-Mir-306 aae-mir-306 MIR-306 CAGGUAC MIMAT0014229 MIMAT0014230 supercont1.785 213078 213173 + Neoptera Neoptera No 1
Bge-Mir-306 None MIR-306 CAGGUAC None None KZ614731.1 668749 668804 - Neoptera Neoptera No 1 1
Dan-Mir-306 dan-mir-306 MIR-306 CAGGUAC MIMAT0008450 None scaffold_12916 15864875 15864933 - Neoptera Neoptera No 1
Dme-Mir-306 dme-mir-306 MIR-306 CAGGUAC MIMAT0000393 MIMAT0000394 2L 16698418 16698476 + Neoptera Neoptera No 1
Dmo-Mir-306 dmo-mir-306 MIR-306 CAGGUAC MIMAT0008648 MIMAT0008649 scaffold_6500 7201959 7202025 + Neoptera Neoptera No 1
Dsi-Mir-306 None MIR-306 CAGGUAC None None 2L 16226178 16226236 + Neoptera Neoptera No 1
Dya-Mir-306 None MIR-306 CAGGUAC None None 2R 4404575 4404633 - Neoptera Neoptera No 1
Hme-Mir-306 hme-mir-306 MIR-306 CAGGUAC MIMAT0024975 None HE669612 9837 9892 - Neoptera Neoptera No
Aae-Mir-927-P1 aae-mir-927 MIR-927 UUAGAAU None MIMAT0014271 supercont1.26 2065419 2065482 + Neoptera Neoptera No 1 1 1
Bge-Mir-927-P1 None MIR-927 UUAGAAU None None KZ614758.1 199474 199532 + Neoptera Neoptera No 1
Dan-Mir-927-P1 None MIR-927 UUAGAAU None None scaffold_13250 3108686 3108747 + Neoptera Neoptera No
Dme-Mir-927-P1 dme-mir-927 MIR-927 UUAGAAU MIMAT0005501 MIMAT0020882 X 15965962 15966023 - Neoptera Neoptera No 1
Dmo-Mir-927-P1 None MIR-927 UUAGAAU None None scaffold_6473 7790782 7790843 - Neoptera Neoptera No 1
Dsi-Mir-927-P1 None MIR-927 UUAGAAU None None X 15019725 15019786 - Neoptera Neoptera No 1
Dya-Mir-927-P1 None MIR-927 UUAGAAU None None X 10049126 10049187 - Neoptera Neoptera No
Hme-Mir-927-P1 hme-mir-927 MIR-927 UUAGAAU MIMAT0024990 None HE669889 61418 61478 + Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-927-P1 tca-mir-927a MIR-927 UUAGAAU MIMAT0008391 MIMAT0019131 LG9 12073274 12073331 + Neoptera Neoptera No 1 1
Aae-Mir-927-P2 aae-mir-10365 MIR-927 UUAGAAU MIMAT0045993 None supercont1.620 576227 576299 - Neoptera Neoptera No 1 1
Hme-Mir-927-P2 None MIR-927 UUAGAAU None None HE667975 146591 146653 - Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-927-P2 tca-mir-927b MIR-927 UUAGAAU MIMAT0023579 MIMAT0023580 LG9 11684286 11684344 - Neoptera Neoptera No 1 1
Bge-Mir-927-P2-v1 None MIR-927 UUUAGAA None None KZ614944.1 401461 401525 + Neoptera Neoptera No 1 1
Bge-Mir-927-P2-v2 None MIR-927 UUAGAAU None None KZ614944.1 401462 401524 + Neoptera Neoptera No 1
Dan-Mir-929 None MIR-929 AAUUGAC None None scaffold_13340 11127750 11127807 + Neoptera Neoptera No 1
Dme-Mir-929 dme-mir-929 MIR-929 AAUUGAC MIMAT0020892 MIMAT0005511 3R 4295385 4295441 + Neoptera Neoptera No 1
Dmo-Mir-929 None MIR-929 AAUUGAC None None scaffold_6540 34020305 34020362 + Neoptera Neoptera No 1
Dsi-Mir-929 dsi-mir-929 MIR-929 AAUUGAC MIMAT0012459 MIMAT0012460 3R 105504 105560 + Neoptera Neoptera No 1
Dya-Mir-929 None MIR-929 AAUUGAC None None 3R 481120 481176 + Neoptera Neoptera No 1
Hme-Mir-929 hme-mir-929 MIR-929 AAUUGAC MIMAT0024992 None HE672076 29049 29106 + Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-929 tca-mir-929 MIR-929 AUUGACU MIMAT0008395 MIMAT0019133 LG9 8050350 8050407 + Neoptera Neoptera No
Bge-Mir-929-v1 None MIR-929 AAUUGAC None None KZ620164.1 1254 1316 + Neoptera Neoptera Yes 1
Bge-Mir-929-v2 None MIR-929 AUUGACU None None KZ620164.1 1255 1315 + Neoptera Neoptera Yes
Aae-Mir-932 aae-mir-932 MIR-932 CAAUUCC MIMAT0014269 MIMAT0014270 supercont1.1064 154116 154175 - Neoptera Neoptera No 1 1
Bge-Mir-932 None MIR-932 CAAUUCC None None KZ617914.1 22888 22946 + Neoptera Neoptera No
Dan-Mir-932 None MIR-932 CAAUUCC None None scaffold_12916 8482577 8482637 + Neoptera Neoptera No 1 1
Dme-Mir-932 dme-mir-932 MIR-932 CAAUUCC MIMAT0005479 MIMAT0020860 2L 6902077 6902137 + Neoptera Neoptera No 1 1 1
Dmo-Mir-932 None MIR-932 CAAUUCC None None scaffold_6500 17707460 17707520 - Neoptera Neoptera No 1 1
Dsi-Mir-932 dsi-mir-932 MIR-932 CAAUUCC MIMAT0012477 MIMAT0012478 2L 6670325 6670385 + Neoptera Neoptera No 1 1 1
Dya-Mir-932 None MIR-932 CAAUUCC None None 2L 6007749 6007809 - Neoptera Neoptera No 1 1 1
Hme-Mir-932 hme-mir-932 MIR-932 CAAUUCC MIMAT0024995 None HE670498 24471 24528 + Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-932 tca-mir-932 MIR-932 CAAUUCC MIMAT0008392 MIMAT0019132 LG5 14056897 14056957 - Neoptera Neoptera No 1
Aae-Mir-971 None MIR-971 UGGUGUU None None supercont1.141 748863 748925 + Neoptera Neoptera No
Dan-Mir-971 None MIR-971 UGGUGUU None None scaffold_13117 3891818 3891881 + Neoptera Neoptera No
Dme-Mir-971 dme-mir-971 MIR-971 UGGUGUU MIMAT0020868 MIMAT0005487 X 13062091 13062152 + Neoptera Neoptera No
Dmo-Mir-971 None MIR-971 UGGUGUU None None scaffold_6328 350127 350186 + Neoptera Neoptera No 1 1
Dsi-Mir-971 None MIR-971 UGGUGUU None None X 12293730 12293791 + Neoptera Neoptera No
Dya-Mir-971 None MIR-971 UGGUGUU None None X 7229804 7229865 + Neoptera Neoptera No
Hme-Mir-971 hme-mir-971 MIR-971 ACUCUAA None MIMAT0024998 HE670834 76896 76955 + Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-971 tca-mir-971b MIR-971 CACUCUA MIMAT0045561 MIMAT0045562 LG4 238976 239037 + Neoptera Neoptera No 1 1
Bge-Mir-971-v1 None MIR-971 ACUCUAA None None KZ615707.1 119208 119269 + Neoptera Neoptera No 1
Bge-Mir-971-v2 None MIR-971 CACUCUA None None KZ615707.1 119207 119269 + Neoptera Neoptera No 1
Bge-Mir-1000 None MIR-1000 UAUUGUC None None KZ615968.1 16799 16859 + Neoptera Neoptera Unknown 1
Dan-Mir-1000 None MIR-1000 UAUUGUC None None scaffold_13340 3670443 3670511 - Neoptera Neoptera No 1
Dme-Mir-1000 dme-mir-1000 MIR-1000 UAUUGUC MIMAT0005520 MIMAT0020900 3R 25588878 25588944 - Neoptera Neoptera No 1
Dmo-Mir-1000 None MIR-1000 UAUUGUC None None scaffold_6540 25791565 25791629 + Neoptera Neoptera No 1
Dsi-Mir-1000 dsi-mir-1000 MIR-1000 UAUUGUC MIMAT0012457 MIMAT0012458 3R 20926899 20926965 - Neoptera Neoptera No 1
Dya-Mir-1000 None MIR-1000 UAUUGUC None None 3R 25064567 25064633 + Neoptera Neoptera No 1
Hme-Mir-1000 hme-mir-1000 MIR-1000 UAUUGUC MIMAT0024933 None HE669583 87273 87327 + Neoptera Neoptera No 1
Tca-Mir-1000 tca-mir-1000 MIR-1000 UAUUGUC MIMAT0010097 MIMAT0019184 LG2 3329648 3329705 + Neoptera Neoptera No 1
Aae-Mir-2796 None MIR-2796 UAGGCCG None None supercont1.309 120075 120135 - Neoptera Neoptera No 1
Bge-Mir-2796 None MIR-2796 UAGGCCG None None KZ614480.1 87921 87980 - Neoptera Neoptera No
Hme-Mir-2796 hme-mir-2796 MIR-2796 UAGGCCG None MIMAT0024962 HE671853 30010 30066 + Neoptera Neoptera Unknown 1
Tca-Mir-2796 tca-mir-2796 MIR-2796 UAGGCCG MIMAT0018712 MIMAT0018713 LG2 14711038 14711098 - Neoptera Neoptera No 1
Bge-Mir-3049 None MIR-3049 CGGGAAG None None KZ614976.1 254390 254450 + Neoptera Neoptera Unknown 1
Tca-Mir-3049 tca-mir-3049 MIR-3049 CGGGAAG MIMAT0018776 MIMAT0018777 LG6 4828785 4828843 + Neoptera Neoptera No 1

Download sequences for: precursor | 5p | 3p | mature | star | mature/star | loop | extend_pre | all