MirGeneDB ID | Dan-Mir-276-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-276 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GCGAGGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dan-mir-276b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dan-Mir-276-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-276-P1 Aga-Mir-276-P1 Bge-Mir-276 Dlo-Mir-276 Dma-Mir-276 Dme-Mir-276-P1 Dmo-Mir-276-P1 Dpu-Mir-276 Dsi-Mir-276-P1 Dya-Mir-276-P1 Gpa-Mir-276-P1 Hme-Mir-276 Isc-Mir-276 Tca-Mir-276 Tur-Mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Diptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13337: 15233400-15233461 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-276-P1) |
Mir-276-P1
scaffold_13337: 15233400-15233461 [+]
Ensembl
Mir-276-P2 scaffold_13337: 15274269-15274329 [+] Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUCUGAAGAAACCGAAGCCUAUUUGCCAUCAGCGAGGUAUAGAGUUCCUACGUGCCACUUAAACUAGUCGUAGGAACUUAAUACCGUGCUCUUGGAGGGCUGUCGACCAUCAUGAAAGUGUAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UUCUGAAGAAACCGAAG-------| AUUUG UC A A UGCCACU CCU CCA AGCG GGUAU GAGUUCCUACG U GGA GGU UCGU CCAUA UUCAAGGAUGC A AUGUGAAAGUACUACCAGCUGUCG^ ----- UC G A UGAUCAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dan-Mir-276-P1_5p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AGCGAGGUAUAGAGUUCCUACG -22
Get sequence
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Star sequence | Dan-Mir-276-P1_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0008446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UAGGAACUUAAUACCGUGCUCU -62
Get sequence
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