| MirGeneDB ID | Dan-Mir-276-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-276 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GCGAGGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dan-mir-276a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Dan-Mir-276-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-276-P2 Aga-Mir-276-P2 Bge-Mir-276 Dlo-Mir-276 Dma-Mir-276 Dme-Mir-276-P2 Dmo-Mir-276-P2 Dpu-Mir-276 Dsi-Mir-276-P2 Dya-Mir-276-P2 Gpa-Mir-276-P2 Hme-Mir-276 Isc-Mir-276 Tca-Mir-276 Tur-Mir-276 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Diptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Arthropoda | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13337: 15274269-15274329 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-276-P2) |
Mir-276-P1
scaffold_13337: 15233400-15233461 [+]
Ensembl
Mir-276-P2 scaffold_13337: 15274269-15274329 [+] Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAAGAUAUUUCUUACCUGGUUUUUGCCAUCAGCGAGGUAUAGAGUUCCUACGUUAACAUUAUAAACUCGUAGGAACUUCAUACCGUGCUCUUGGAAGACCUAAAAUCAACGAAAACAUAAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CAAGAUAUUUCUUACCU----| UG UC A AG UUAACAU GGUUUU CCA AGCG GGUAU AGUUCCUACG \ CCAGAA GGU UCGU CCAUA UCAAGGAUGC U AAAUACAAAAGCAACUAAAAU^ -- UC G CU UCAAAUA . 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dan-Mir-276-P2_5p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AGCGAGGUAUAGAGUUCCUACG -22
Get sequence
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| Star sequence | Dan-Mir-276-P2_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0008455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UAGGAACUUCAUACCGUGCUCU -61
Get sequence
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