| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-282 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGCCUCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-282-P1 Aae-Mir-282-P2 Bge-Mir-282 Dan-Mir-282 Dma-Mir-282-v1 Dma-Mir-282-v2 Dme-Mir-282 Dmo-Mir-282 Dpu-Mir-282 Dya-Mir-282 Hme-Mir-282 Tca-Mir-282 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Pancrustacea | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
3L: 3148587-3148651 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-282) |
Mir-282
3L: 3148587-3148651 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-955 3L: 3195958-3196020 [+] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CGUUCUUAAACUAAAGUUUCCUUUUAAAUCUAGCCUCUACUAGGCUUUGUCUGUGCAUUCGAAAGCCGAUCAGACAUAGCCUAUAAGAGGUUAGGUGUACCAAGGCGAACAAUCAGCGAAAACGGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 CGUUCUUAAACUAAAGUUU- UUAA-| AC U GUGCAUUCG CCUU AUCUAGCCUCU UAGGCU UGUCU \ GGAA UGGAUUGGAGA AUCCGA ACAGA A GGCAAAAGCGACUAACAAGC CCAUG^ AU U CUAGCCGAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dsi-Mir-282_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0008883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UAGCCUCUACUAGGCUUUGUCU -22
Get sequence
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| Star sequence | Dsi-Mir-282_3p* |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
43- ACAUAGCCUAUAAGAGGUUAGG -65
Get sequence
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