MirGeneDB ID | Dsi-Mir-974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-974 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGCGAGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dsi-mir-974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dan-Mir-974 Dme-Mir-974 Dmo-Mir-974 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
X: 18323461-18323522 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-974) |
Mir-972
X: 18322964-18323019 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-9369 X: 18323144-18323204 [+] UCSC Ensembl Mir-973 X: 18323323-18323387 [+] UCSC Ensembl Mir-974 X: 18323461-18323522 [+] UCSC Ensembl Mir-975 X: 18330806-18330866 [+] UCSC Ensembl Mir-976 X: 18330933-18330991 [+] UCSC Ensembl Mir-977 X: 18331071-18331133 [+] UCSC Ensembl Mir-978-v1 X: 18333231-18333293 [+] UCSC Ensembl Mir-978-v2 X: 18333232-18333292 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UAAACUCAAUUGUCACUGGUCGUGUCCUCCAAGCGAGCAAAGAAGUGGUAUUUGCGUUUCCAAGAACAAAUAUAACUUCUUUGAAAGCUAGGUGGAUUUGCCCAAGUCACCUUGGUAUUUAUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 UAAACUCAAUUGUCACU--| U U U A GAG G UGCGUUU GG CG GUCC CC AGC CAAAGAAGU GUAUU C CC GU UAGG GG UCG GUUUCUUCA UAUAA C UAUUUAUGGUUCCACUGAA^ C U U A AAA A ACAAGAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dsi-Mir-974_5p |
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mirBase accession | MIMAT0039120 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AAGCGAGCAAAGAAGUGGUAUU -22
Get sequence
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Co-mature sequence | Dsi-Mir-974_3p |
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mirBase accession | MIMAT0039121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
40- UAUAACUUCUUUGAAAGCUAGG -62
Get sequence
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