MirGeneDB ID | Dsi-Mir-973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-973 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | GGUUGGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dsi-mir-973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Dan-Mir-973 Dme-Mir-973 Dmo-Mir-973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Drosophila | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
X: 18323323-18323387 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-973) |
Mir-972
X: 18322964-18323019 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-9369 X: 18323144-18323204 [+] UCSC Ensembl Mir-973 X: 18323323-18323387 [+] UCSC Ensembl Mir-974 X: 18323461-18323522 [+] UCSC Ensembl Mir-975 X: 18330806-18330866 [+] UCSC Ensembl Mir-976 X: 18330933-18330991 [+] UCSC Ensembl Mir-977 X: 18331071-18331133 [+] UCSC Ensembl Mir-978-v1 X: 18333231-18333293 [+] UCSC Ensembl Mir-978-v2 X: 18333232-18333292 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGAUUAUAUGACUUUAACGUAUACUUUUCCGGGUUGGUGGUUGAACUUCGAUUUUAAGCAUUUAAAUAAGAUAAAUCUGUUCAUUCUUCGACCCAAAAAGUUCACGUGAAGAAGCAGCGAACAUCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AGAUUAUAUGACUUUAA--| AU CC U GU UUC UAAGCAUU CGU ACUUUU GGGUUGG G UGAAC GAUUU U GCA UGAAAA CCCAGCU C ACUUG CUAAA A CUACAAGCGACGAAGAAGU^ CU A- U UU U-- UAGAAUAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Dsi-Mir-973_5p |
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mirBase accession | MIMAT0039113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GGGUUGGUGGUUGAACUUCGAUUUU -25
Get sequence
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Star sequence | Dsi-Mir-973_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0039114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
43- AAUCUGUUCAUUCUUCGACCCA -65
Get sequence
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