| MirGeneDB ID | Dsi-Mir-988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-988 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | CCCUUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Fruit fly (Drosophila simulans) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | dsi-mir-988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aae-Mir-988 Dan-Mir-988 Dme-Mir-988 Dmo-Mir-988 Dya-Mir-988 Hme-Mir-988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Diptera plus Lepidoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Diptera plus Lepidoptera | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Drosophila_simulans.ASM75419v3.dna.toplevel) |
2R: 8750716-8750773 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-988) |
Mir-988
2R: 8750716-8750773 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-281-P1-v1 2R: 8762476-8762542 [-] UCSC Ensembl Mir-281-P1-v2 2R: 8762477-8762541 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UUUUUGAUGGCGGUACCGGGCAUUUUGGGUGUGUGAUUUGUAGCAAAGUGAUAUGUAUUUGAUCAUCCCCUUGUUGCAAACCUCACGCCAAAGAUGAUCUGAGAAAUACACAGUGAUAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 UUUUUGAUGGCGGUACC- -| G UGA AGU AUGUA GGG CAUUUU GGUGUG UUUGUAGCAA GAU U UCU GUAGAA CCGCAC AAACGUUGUU CUA U AUAGUGACACAUAAAGAG A^ A UCC CCC CUAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Dsi-Mir-988_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0012435 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GUGUGAUUUGUAGCAAAGUGAU -22
Get sequence
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| Mature sequence | Dsi-Mir-988_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0012436 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- CCCCUUGUUGCAAACCUCACGC -58
Get sequence
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