| MirGeneDB ID | Eba-Mir-2722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Family name | MIR-2722 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGCGCCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Epimenia (Solenogaster) (Epimenia babai) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-2722 Esc-Mir-2722 Hru-Mir-2722 Lgi-Mir-2722 Lhy-Mir-2722 Mgi-Mir-2722 Mom-Mir-2722 Npo-Mir-2722 Obi-Mir-2722 Ovu-Mir-2722 Pve-Mir-2722 Rph-Mir-2722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Mollusca | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Mollusca | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_011762755.2_ASM1176275v2_Epimenia) |
WURV02051454.1: 7248-7310 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | ACACAUAUUUUUAUGCCGGUCGGUGCGGGUGAGGUGUUUCACGGGCGGACCACUGUGUCAAAGUAGUCAAGUGGCGCCGUGUAAACAUCUAACUCGAAUCUACAACAGCCAGCACCACGACUGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 ACACAUAUUUUUAUGCCG-- C G G - -| GGACCACUGUGUC GU GGU CGGGU AGGUGUUU CACGG GC \ CA CUA GCUCA UCUACAAA GUGCC CG A GUCAGCACCACGACCGACAA U A A U G^ GUGAACUGAUGAA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Star sequence | Eba-Mir-2722_5p* (predicted) |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAGGUGUUUCACGGGCGGAC -20
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mature sequence | Eba-Mir-2722_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
41- UGGCGCCGUGUAAACAUCUAAC -63
Get sequence
|
