| MirGeneDB ID | Lhy-Mir-2722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-2722 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GGCGCCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Laevipilina (Monoplacophora) (Laevipilina hyalina) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Agr-Mir-2722 Eba-Mir-2722 Esc-Mir-2722 Hru-Mir-2722 Lgi-Mir-2722 Mgi-Mir-2722 Mom-Mir-2722 Npo-Mir-2722 Obi-Mir-2722 Ovu-Mir-2722 Pve-Mir-2722 Rph-Mir-2722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Mollusca | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Mollusca | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (Mono_atcgn_nospaces) |
scaffold205902_42.5: 6765-6820 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CACUGAGUAACACUUAUUUAUCCCACCAGAGAGGUGUUUCAUGGGUGCUACACGGAGAUAGACGUGGCGCCGUGUAAACAUCUAGCUGGCGAGUUAAACUCUACGACGCACGAGAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 CACUGAGUAACACUUAUUUAUCCCA-- AG -| G ACGGA CCAG AGGUGUUU CAUGG UGCUAC G GGUC UCUACAAA GUGCC GCGGUG A AAGAGCACGCAGCAUCUCAAAUUGAGC GA U^ - CAGAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Lhy-Mir-2722_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- GAGGUGUUUCAUGGGUGCUACA -22
Get sequence
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| Mature sequence | Lhy-Mir-2722_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
34- UGGCGCCGUGUAAACAUCUAGC -56
Get sequence
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