MirGeneDB ID | Hsa-Mir-430-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-372 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-430-P1 Hsa-Mir-430-P2 Hsa-Mir-430-P3 Hsa-Mir-430-P4 Hsa-Mir-430-P5 Hsa-Mir-430-P7 Hsa-Mir-430-P8a Hsa-Mir-430-P8b Hsa-Mir-430-P9 Hsa-Mir-430-P10 Hsa-Mir-430-P11 Hsa-Mir-430-P12a Hsa-Mir-430-P12b Hsa-Mir-430-P13 Hsa-Mir-430-P14 Hsa-Mir-430-P15 Hsa-Mir-430-P16a Hsa-Mir-430-P16b Hsa-Mir-430-P17 Hsa-Mir-430-P18 Hsa-Mir-430-P19 Hsa-Mir-430-P20 Hsa-Mir-430-P21 Hsa-Mir-430-P22 Hsa-Mir-430-P23 Hsa-Mir-430-P24 Hsa-Mir-430-P25 Hsa-Mir-430-P26 Hsa-Mir-430-P27 Hsa-Mir-430-P28 Hsa-Mir-430-P29a Hsa-Mir-430-P29b Hsa-Mir-430-P29c Hsa-Mir-430-P30 Hsa-Mir-430-P31a Hsa-Mir-430-P31b Hsa-Mir-430-P32 Hsa-Mir-430-P33a Hsa-Mir-430-P33b Hsa-Mir-430-P34a Hsa-Mir-430-P34b Hsa-Mir-430-P35 Hsa-Mir-430-P36 Hsa-Mir-430-P37a Hsa-Mir-430-P37b Hsa-Mir-430-P37c Hsa-Mir-430-P38 Hsa-Mir-430-P39 Hsa-Mir-430-P40a Hsa-Mir-430-P40b Hsa-Mir-430-P41a Hsa-Mir-430-P41b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-430-P6 Dno-Mir-430-P6 Eca-Mir-430-P6 Mml-Mir-430-P6 Mmr-Mir-430-P6 Mmu-Mir-430-P6 Pab-Mir-430-P6 Rno-Mir-430-P6a Rno-Mir-430-P6b Xla-Mir-430-o6a Xla-Mir-430-o6b Xtr-Mir-430-o6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chr19: 53787895-53787953 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-430-P6) |
Mir-430-P37b
chr19: 53739348-53739407 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-430-P29c chr19: 53741332-53741390 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P33b chr19: 53742528-53742587 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P31b chr19: 53748650-53748710 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P39 chr19: 53751226-53751285 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P40a chr19: 53752410-53752470 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P37c chr19: 53754031-53754089 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P41b chr19: 53756756-53756818 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P16b chr19: 53758246-53758304 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P41a chr19: 53761148-53761210 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P40b chr19: 53762358-53762418 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P5 chr19: 53787680-53787738 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P6 chr19: 53787895-53787953 [+] UCSC Ensembl Mir-430-P7 chr19: 53788710-53788770 [+] UCSC Ensembl |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UCUUGCAGAUGGAGCUGCUCACCCUGUGGGCCUCAAAUGUGGAGCACUAUUCUGAUGUCCAAGUGGAAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGUCACCGGUGACGCCCAUAUCAACGGAUGCCGGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UCUUGCAGAUGGAGCUGC---| CU G - - G A GAUGU UCACC GUGG C CUCAAAUGU G AGCACU UUCU \ AGUGG CACU G GAGUUUACA C UCGUGA AAGG C GCCGUAGGCAACUAUACCCGC^ C- - C G G - UGAAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Hsa-Mir-430-P6_5p* |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0026484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- CCUCAAAUGUGGAGCACUAUUCU -23
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
TargetScanVert: hsa-miR-372-5p miRDB: MIMAT0026484 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Hsa-Mir-430-P6_3p |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | MIMAT0000724 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU -59
Get sequence
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000724 TargetScanVert: hsa-miR-372-3p miRDB: MIMAT0000724 |