MirGeneDB ID | Laf-Mir-452 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Family name | MIR-452 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACUGUUU | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-452-v1 Bta-Mir-452-v2 Cfa-Mir-452-v1 Cfa-Mir-452-v2 Cja-Mir-452-v1 Cja-Mir-452-v2 Cpo-Mir-452-v1 Cpo-Mir-452-v2 Ete-Mir-452-v1 Ete-Mir-452-v2 Hsa-Mir-452-v1 Hsa-Mir-452-v2 Mml-Mir-452-v1 Mml-Mir-452-v2 Mmr-Mir-452-v1 Mmr-Mir-452-v2 Mmu-Mir-452-v1 Mmu-Mir-452-v2 Ocu-Mir-452-v1 Ocu-Mir-452-v2 Pab-Mir-452-v1 Pab-Mir-452-v2 Rno-Mir-452-v1 Rno-Mir-452-v2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010138.1: 2359494-2359558 [-] UCSC Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCUCCUGUCUUGUAAAUGCUAAGCACUUACAACUGUUUGCAGAGGAAACUGAGACUUUGUAGCUAUGUCUCAGUCUCAUCUGCAAAGAAGUAAGUGCUUUGCCAAGCCCCGGAAAGGGUAGGUAAGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GCUCCUGUCUUGUAAAU------| U AA GU G A CUUUGU GC AAGCACUUAC CU UUGCAGA GA ACUGAGA \ CG UUCGUGAAUG GA AACGUCU CU UGACUCU A AAUGGAUGGGAAAGGCCCCGAAC^ U AA -- A C GUAUCG 120 110 100 90 80 70 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mature sequence | Laf-Mir-452_5p (predicted) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- AACUGUUUGCAGAGGAAACUGAGA -24
Get sequence
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Star sequence | Laf-Mir-452_3p* |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- UCAGUCUCAUCUGCAAAGAAGUAAGU -65
Get sequence
|