| MirGeneDB ID | Mal-Mir-203-P2-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-203 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | GAAAUGU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Asian swamp eel (Monopterus albus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Mal-Mir-203-P1-v1 Mal-Mir-203-P1-v2 Mal-Mir-203-P2-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Dre-Mir-203-P2-v1 Dre-Mir-203-P2-v2 Gmo-Mir-203-P2-v1 Gmo-Mir-203-P2-v2 Lch-Mir-203 Pma-Mir-203-o2-v1 Pma-Mir-203-o2-v2 Spt-Mir-203 Tni-Mir-203-P2-v1 Tni-Mir-203-P2-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Clupeocephala | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_001952655.1_M_albus_1.0_genomic) |
KV884701.1: 1040824-1040885 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GCCUAGAAGAAGUGCCUAGUCUCGCUGAUUAAGUGGUUCUUAACAGUUCAACAGUUCUUUGACAAAAUUGUGAAAUGUUUAGGACCACUUGACCAGUCAGACAAAUGCUGCCAGCUUUUGAAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 GCCUAGAAGAAGUGCCUA--| C A U G A GUUCUUU GUCU GCUG UUAAGUGGUUCU AACA UUCA CA \ CAGA UGAC AGUUCACCAGGA UUGU AAGU GU G AAGUUUUCGACCGUCGUAAA^ C C U A - UAAAACA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mal-Mir-203-P2-v2_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGUGGUUCUUAACAGUUCAACA -23
Get sequence
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| Mature sequence | Mal-Mir-203-P2-v2_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- UGAAAUGUUUAGGACCACUUGA -62
Get sequence
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