MirGeneDB ID | Mmr-Mir-337-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-337 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | UCCUAUA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mmr-Mir-337-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Cja-Mir-337 Cpo-Mir-337-v2 Dno-Mir-337-v2 Eca-Mir-337 Hsa-Mir-337-v2 Laf-Mir-337 Mml-Mir-337-v2 Mmu-Mir-337 Ocu-Mir-337-v2 Pab-Mir-337 Rno-Mir-337 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007663.1: 12577986-12578046 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-337-v2) |
Mir-136-v1
CM007663.1: 12587343-12587398 [+]
UCSC
Ensembl
Mir-136-v2 CM007663.1: 12587343-12587398 [+] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CGCGGCCCGUAGUCAGUAGUUGGGGGGUGGGAACGGCUUCAUACAGGAGUUGAUUGCACAGUUAUUCAGCUCCUAUAUGAUGCCUUUCUUCAUCCCCUUCAACCACACGCAGCCUCCGGACGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CGCGGCCCGUAGUCAGUA -- -| C U C GAUUGCA GUUG GGGGGUG GGAA GGC UCAUA AGGAGUU C CAAC CCCCUAC UCUU CCG AGUAU UCCUCGA A CAGGCCUCCGACGCACAC UU U^ U U A CUUAUUG . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmr-Mir-337-v2_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- GAACGGCUUCAUACAGGAGUU -21
Get sequence
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Mature sequence | Mmr-Mir-337-v2_3p |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
39- CUCCUAUAUGAUGCCUUUCUUC -61
Get sequence
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