MirGeneDB ID | Mmr-Mir-430-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AGUGCUU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Gray mouse lemur (Microcebus murinus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Mmr-Mir-430-P1 Mmr-Mir-430-P2 Mmr-Mir-430-P3 Mmr-Mir-430-P4 Mmr-Mir-430-P5e Mmr-Mir-430-P5f Mmr-Mir-430-P6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-430-P7 Cfa-Mir-430-P7d1 Cfa-Mir-430-P7d2 Cja-Mir-430-P7 Eca-Mir-430-P7 Hsa-Mir-430-P7 Laf-Mir-430-P7 Mml-Mir-430-P7 Mmu-Mir-430-P7a Mmu-Mir-430-P7b Mmu-Mir-430-P7c Pab-Mir-430-P7 Rno-Mir-430-P7a Rno-Mir-430-P7b Rno-Mir-430-P7c Xla-Mir-430-o7a Xla-Mir-430-o7b Xtr-Mir-430-o7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCA_000165445.3_Mmur_3.0_genomic) |
CM007682.1: 10861205-10861262 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CGGGAACAGUCUUGAGCUCAAGACCGUGUUACUCAAAAUGGAGGCACUUCCCUUUGUCUUCACUGGAAAGUGCUUCUGUUUUGGGUCUCGCUGUUUGAGGAAGGCGUCUCAUCUUCCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CGGGAACAGUCUUGAGC---| A C UU C UUUGU UCA GAC GUG ACUCAAAAUGGAGGCACUU CC C AGU UUG CGC UGGGUUUUGUCUUCGUGAA GG U ACCUUCUACUCUGCGGAAGG^ - U UC A UCACU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Mmr-Mir-430-P7_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUCAAAAUGGAGGCACUUCCC -22
Get sequence
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Mature sequence | Mmr-Mir-430-P7_3p (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
37- AAGUGCUUCUGUUUUGGGUCU -58
Get sequence
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