| MirGeneDB ID | Laf-Mir-430-P7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-430 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AAGUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | African bush elephant (Loxodonta africana) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Laf-Mir-430-o44 Laf-Mir-430-P1 Laf-Mir-430-P2 Laf-Mir-430-P3 Laf-Mir-430-P4 Laf-Mir-430-P5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-430-P7 Cfa-Mir-430-P7d1 Cfa-Mir-430-P7d2 Cja-Mir-430-P7 Eca-Mir-430-P7 Hsa-Mir-430-P7 Mml-Mir-430-P7 Mmr-Mir-430-P7 Mmu-Mir-430-P7a Mmu-Mir-430-P7b Mmu-Mir-430-P7c Pab-Mir-430-P7 Rno-Mir-430-P7a Rno-Mir-430-P7b Rno-Mir-430-P7c Xla-Mir-430-o7a Xla-Mir-430-o7b Xtr-Mir-430-o7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_000001905.1_Loxafr3.0) |
GL010031.1: 14870696-14870755 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGAAGUUGGAAGAGAAUACUCAGCCUGGAUUUCUCAAAACUGGGGCACUCUCCUUUGUCUGGUAGGAAAGUGCUCCCACUUUUGGGAAUCUGUUUUGAGAAAAACAUCUGGACCAGACUCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AGAAGUUGGAAGAGAAUA---| CC U C - CUCCUUUGU CUCAG UGGAUUUC CAAAA UGGG GCACU \ GAGUU GUCUAAGG GUUUU ACCC CGUGA C CUCAGACCAGGUCUACAAAAA^ UU - C U AAGGAUGGU . 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | Unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Laf-Mir-430-P7_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCUCAAAACUGGGGCACUCU -21
Get sequence
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| Mature sequence | Laf-Mir-430-P7_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- AAAGUGCUCCCACUUUUGGGAAUC -60
Get sequence
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