| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-28 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | AGGAGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-28a | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-28 Cfa-Mir-28 Cja-Mir-28 Cpo-Mir-28 Dno-Mir-28 Eca-Mir-28 Ete-Mir-28 Hsa-Mir-28 Laf-Mir-28 Mml-Mir-28 Mmr-Mir-28 Ocu-Mir-28 Pab-Mir-28 Rno-Mir-28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr16: 24827868-24827929 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGAGGAAGCAUAGAGGUGGUCCCUACCUUCAAGGAGCUCACAGUCUAUUGAGUUGCCUUUCUGAUUCUCCCACUAGAUUGUGAGCUGCUGGAGGGCAGGCACUUGAAUUCAUCUGAAAAGGUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGAGGAAGCAUAGAGGU--| C A A G U AGUUGCCUU GGU CCU CCUUC AG AGCUCACAGUCUA UG U UCA GGA GGGAG UC UCGAGUGUUAGAU AC C UGGAAAAGUCUACUUAAGU^ C C G G C CCUCUUAGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-28_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0000653 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AAGGAGCUCACAGUCUAUUGAG -22
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000653 TargetScanVert: mmu-miR-28a-5p miRDB: MIMAT0000653 |
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| Co-mature sequence | Mmu-Mir-28_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0004661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
40- CACUAGAUUGUGAGCUGCUGGA -62
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004661 TargetScanVert: mmu-miR-28a-3p miRDB: MIMAT0004661 |
