| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-670 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUCCUCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-670 Cja-Mir-670 Cpo-Mir-670 Dno-Mir-670 Eca-Mir-670 Hsa-Mir-670 Laf-Mir-670 Mml-Mir-670 Mmr-Mir-670 Ocu-Mir-670 Pab-Mir-670 Rno-Mir-670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chr2: 94261316-94261379 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-670) |
Mir-129-P1
chr2: 94241376-94241439 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-670 chr2: 94261316-94261379 [-] UCSC Ensembl |
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| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGCUACACGUGGUUUGGAGGUGGGCCUGACAUCCCUGAGUGUAUGUGGUGAACCUGAACUUGCCCUGGGUUUCCUCAUAUCCAUUCAGGAGUGUCAGCUGCCUCUUCGCUCAACGCUCGCUGGAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 UGCUACACGUGGUUUGG----| UG GC UC U - UG UGAACU AGG G CUGACA CCUGAGUG AUGUG G AACC \ UCC C GACUGU GGACUUAC UAUAC C UUGG U AGGUCGCUCGCAACUCGCUUC^ GU -- GA C U CU GUCCCG 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Mmu-Mir-670_5p* |
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| mirBase accession | MIMAT0003736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- AUCCCUGAGUGUAUGUGGUGAACC -24
Get sequence
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| Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003736 TargetScanVert: mmu-miR-670-5p miRDB: MIMAT0003736 |
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| Mature sequence | Mmu-Mir-670_3p |
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| mirBase accession | MIMAT0017242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
39- UUUCCUCAUAUCCAUUCAGGAGUGU -64
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-670-3p miRDB: MIMAT0017242 |
