MirGeneDB ID | Aga-Mir-67-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CACAACC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | African malaria mosquito (Anopheles gambiae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | aga-mir-307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Aga-Mir-67-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-67-v1 Agr-Mir-67-v1 Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cte-Mir-67 Dan-Mir-67-v1 Dgr-Mir-67 Dma-Mir-67 Dme-Mir-67-v1 Dmo-Mir-67-v1 Dpu-Mir-67 Dsi-Mir-67-v1 Dya-Mir-67-v1 Eba-Mir-67-v1 Egr-Mir-67 Gsa-Mir-67 Hme-Mir-67-v1 Hru-Mir-67 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Mom-Mir-67-v1 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ofu-Mir-67 Ovu-Mir-67 Pau-Mir-67 Pca-Mir-67 Pcr-Mir-67-v1 Pdu-Mir-67 Pve-Mir-67-v1 Rph-Mir-67-v1 Sma-Mir-67 Sme-Mir-67 Snu-Mir-67 Tca-Mir-67-v1 Tur-Mir-67 War-Mir-67-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (GCF_943734735.2_idAnoGambNW_F1_1_genomic) |
NC_064602.1: 91904833-91904891 [+] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-v1) |
Mir-67-v1
NC_064602.1: 91904833-91904891 [+]
Ensembl
Mir-67-v2 NC_064602.1: 91904833-91904891 [+] Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CUCUCUCUCUCUGGACUCAUUCUCUCGAUCACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGCUUUUUUGAAUCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGACCGCGGAUUGACUAAAACCACACAUACGCAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CUCUCUCUCUCUGGACU---| U U U A A CCU G CUUUU CA UC C CG UC CUCACUCAA GG UGUGAUG \ GU AG G GC AG GAGUGAGUU CC ACACUAC U ACGCAUACACACCAAAAUCA^ U - C C C CCU A UAAGU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Aga-Mir-67-v1_5p* (predicted) |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGAUG -23
Get sequence
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Mature sequence | Aga-Mir-67-v1_3p |
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mirBase accession | MIMAT0001519 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- UCACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -59
Get sequence
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