MirGeneDB ID | Dan-Mir-67-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACAACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Fruit fly (Drosophila ananassae) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | dan-mir-307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Dan-Mir-67-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-67-v2 Aga-Mir-67-v2 Agr-Mir-67-v2 Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Cte-Mir-67 Dgr-Mir-67 Dma-Mir-67 Dme-Mir-67-v2 Dmo-Mir-67-v2 Dpu-Mir-67 Dsi-Mir-67-v2 Dya-Mir-67-v2 Eba-Mir-67-v2 Egr-Mir-67 Gsa-Mir-67 Hme-Mir-67-v2 Hru-Mir-67 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Mom-Mir-67-v2 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ofu-Mir-67 Ovu-Mir-67 Pau-Mir-67 Pca-Mir-67 Pcr-Mir-67-v2 Pdu-Mir-67 Pve-Mir-67-v2 Rph-Mir-67-v2 Sma-Mir-67 Sme-Mir-67 Snu-Mir-67 Tca-Mir-67-v2 Tur-Mir-67 War-Mir-67-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Dana_caf1) |
scaffold_13266: 12795492-12795557 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-v2) |
Mir-67-v1
scaffold_13266: 12795492-12795557 [-]
Ensembl
Mir-67-v2 scaffold_13266: 12795492-12795557 [-] Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | GAAAGUUAGCAGCCUUUUUGUCUUGCUUUGACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGUUAUUUCGAUAUGGUAUCCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGAUAGCAGGACAGAGUAUCCACAAGACUAACUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 GAAAGUUAGCAGCCUUU-- -| A CCU G GUUAUUUCG UUGUCUUGCU UUG CUCACUCAA GG UGUGAU A GACAGGACGA AGC GAGUGAGUU CC ACACUA U UCAAUCAGAACACCUAUGA U^ - CCU A CCUAUGGUA 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Dan-Mir-67-v2_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGAU -22
Get sequence
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Mature sequence | Dan-Mir-67-v2_3p |
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mirBase accession | MIMAT0008434 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
44- CACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -66
Get sequence
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