MirGeneDB ID | Hme-Mir-67-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-67 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | ACAACCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Longwing butterfly (Heliconius melpomene) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hme-mir-307 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hme-Mir-67-v1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aae-Mir-67-v2 Asu-Mir-67 Bge-Mir-67 Cbr-Mir-67 Cel-Mir-67 Csc-Mir-67 Cte-Mir-67 Dan-Mir-67-v2 Dma-Mir-67 Dme-Mir-67-v2 Dmo-Mir-67-v2 Dpu-Mir-67 Dsi-Mir-67-v2 Dya-Mir-67-v2 Isc-Mir-67 Lan-Mir-67 Lgi-Mir-67 Npo-Mir-67 Obi-Mir-67 Ovu-Mir-67 Sme-Mir-67 Tca-Mir-67-v2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Protostomia | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (Hmel_1) |
HE671244: 79056-79123 [-] Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-67-v2) |
Mir-67-v1
HE671244: 79056-79123 [-]
Ensembl
Mir-67-v2 HE671244: 79056-79123 [-] Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGAAGAAAUGUGAAAUGCUCAUUUCCGGCUACUCACUCAACCUGGGUGUGAUGUGUGCACUCGUUGCUCGGCCCAUCACAACCUCCUUGAGUGAGCGACCGUGGGUGGGACAUCUACAUUAAAAAAUAGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 60 AGAAGAAAUGUGAAAUG--| UC CUA CCU G GUGUGCACUC CUCAUU CGG CUCACUCAA GG UGUGAU G GGGUGG GCC GAGUGAGUU CC ACACUA U AUAAAAAAUUACAUCUACA^ GU AGC CCU A CCCGGCUCGU 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | CNNC at 3p(+17), UGUG in loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Star sequence | Hme-Mir-67-v2_5p* |
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mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- ACUCACUCAACCUGGGUGUGAU -22
Get sequence
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Mature sequence | Hme-Mir-67-v2_3p |
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mirBase accession | MIMAT0024976 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
46- CACAACCUCCUUGAGUGAGCGA -68
Get sequence
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