| MirGeneDB ID | Dno-Mir-1271 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1271 (all species) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UUGGCAC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1271 Cfa-Mir-1271 Cpo-Mir-1271 Eca-Mir-1271 Ete-Mir-1271 Hsa-Mir-1271 Laf-Mir-1271 Mml-Mir-1271 Mmu-Mir-1271 Pab-Mir-1271 Rno-Mir-1271 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (dasNov3) |
JH562710: 929911-929968 [+] UCSC Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGCCCUGUACCUGCAGCACCCAGAUGAGUGCUUGGCACCUAGUAAGCACACAGUAAACUCUUGUUGGGUGCCUGCUGUGUGCCAGGCAUGGAGCUGGGGCUUUUGGGGGUCCAAAGGUGet precursor sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 AGCCCUGUACCUGCAGCA--| AUGA C A A GUAAA CCCAG GUGCUUGGCAC UAGUA GCAC CA C GGGUC UACGGACCGUG GUCGU CGUG GU U UGGAAACCUGGGGGUUUUCG^ GAGG U C G UGUUC 110 100 90 80 70 60 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | Unknown | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | No | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Dno-Mir-1271_5p |
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| mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- CUUGGCACCUAGUAAGCACACA -22
Get sequence
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| Star sequence | Dno-Mir-1271_3p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- GGUGCCUGCUGUGUGCCAGGCA -58
Get sequence
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