MirGeneDB ID | Hsa-Mir-105-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-105 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | CAAAUGC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Human (Homo sapiens) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | hsa-mir-105-2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | Hsa-Mir-105-P2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Bta-Mir-105-P1 Cfa-Mir-105-P1 Cja-Mir-105-P1 Cpo-Mir-105-P1 Eca-Mir-105-P1 Ete-Mir-105-P1 Mml-Mir-105-P1 Mmr-Mir-105-P1 Mmu-Mir-105-P1 Ocu-Mir-105-P1 Pab-Mir-105-P1 Rno-Mir-105-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (hg38) |
chrX: 152394422-152394480 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Clustered miRNAs (< 50kb from Mir-105-P1) |
Mir-105-P2
chrX: 152392229-152392287 [-]
UCSC
Ensembl
Mir-105-P1 chrX: 152394422-152394480 [-] UCSC Ensembl |
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Precursor (pre-Mir +30nt flank) | UGUUGCAGAUCUUCUGUGUGUGCAUCGUGGUCAAAUGCUCAGACUCCUGUGGUGGCUGCUUAUGCACCACGGAUGUUUGAGCAUGUGCUAUGGUGUCUACUUUUGCAACAUUGCCAUCUGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 UGUUGCAGAUCUUCUGU--| U U A UC GCUG GUG GCAUCGUGG CA AUGCUCAGAC CUGUGGUG C CAU UGUGGUAUC GU UACGAGUUUG GGCACCAC U UCUACCGUUACAACGUUUU^ C - G UA GUAU 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Hsa-Mir-105-P1_5p |
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mirBase accession | MIMAT0000102 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UCAAAUGCUCAGACUCCUGUGGUG -24
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0000102 TargetScanVert: hsa-miR-105-5p TargetMiner: hsa-miR-105-5p miRDB: MIMAT0000102 |
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Star sequence | Hsa-Mir-105-P1_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0004516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
36- CCACGGAUGUUUGAGCAUGUGCU -59
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0004516 TargetScanVert: hsa-miR-105-3p TargetMiner: hsa-miR-105-3p miRDB: MIMAT0004516 |