| MirGeneDB ID | Mmu-Mir-1298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-1298 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UCAUUCG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | mmu-mir-1298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Bta-Mir-1298 Cfa-Mir-1298 Cja-Mir-1298 Cpo-Mir-1298 Eca-Mir-1298 Ete-Mir-1298 Hsa-Mir-1298 Laf-Mir-1298 Mml-Mir-1298 Mmr-Mir-1298 Ocu-Mir-1298 Pab-Mir-1298 Rno-Mir-1298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Eutheria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (mm10) |
chrX: 147064918-147064991 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) | AGAAGUGUUGGAGAGAUGAGGGGUUAAGAGUUCAUUCGGCUGUCCAGAUGUACCCAAGUACCCUGUUAUUUGGCAAUACAUACAUCUGGGCAACUGAUUGAACUUUUCGCUUCUCUUGACUCAACUGGAGCAUCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | 10 20 30 40 50 60 AGAAGUGUUGGAGAGAU--| U U C CCCAAGUACCCUG GAGGGGU AAGAGUUCA UCGG UGUCCAGAUGUA U CUCUUCG UUUUCAAGU AGUC ACGGGUCUACAU U CUACGAGGUCAACUCAGUU^ C U A ACAUAACGGUUUA 130 120 110 100 90 80 70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing |
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| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | UG at 5p(-14), CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Mature sequence | Mmu-Mir-1298_5p |
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| mirBase accession | MIMAT0014809 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- UUCAUUCGGCUGUCCAGAUGUA -22
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1298-5p miRDB: MIMAT0014809 |
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| Star sequence | Mmu-Mir-1298_3p* |
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| mirBase accession | MIMAT0014810 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
52- CAUCUGGGCAACUGAUUGAACU -74
Get sequence
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| Proposed targets |
TargetScanVert: mmu-miR-1298-3p miRDB: MIMAT0014810 |
