MirGeneDB ID | Mmu-Mir-455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Family name | MIR-455 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Seed | AUGUGCC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | House mouse (Mus musculus) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
MiRBase ID | mmu-mir-455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Paralogues | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologues | Aca-Mir-455 Ami-Mir-455 Bta-Mir-455 Cfa-Mir-455 Cli-Mir-455 Cmi-Mir-455 Cpi-Mir-455 Cpo-Mir-455 Dno-Mir-455 Dre-Mir-455-P1 Dre-Mir-455-P2 Ebu-Mir-455-v1 Ebu-Mir-455-v2 Ete-Mir-455 Gga-Mir-455 Gja-Mir-455 Gmo-Mir-455-P1 Gmo-Mir-455-P2 Hsa-Mir-455 Lch-Mir-455 Loc-Mir-455 Mal-Mir-455-P1 Mal-Mir-455-P2 Mdo-Mir-455 Mml-Mir-455 Mun-Mir-455 Oan-Mir-455 Ocu-Mir-455 Pbv-Mir-455 Pma-Mir-455 Rno-Mir-455 Sha-Mir-455 Spt-Mir-455 Sto-Mir-455 Tgu-Mir-455 Tni-Mir-455-P1 Tni-Mir-455-P2 Xla-Mir-455-P3 Xla-Mir-455-P4 Xtr-Mir-455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (locus) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Node of Origin (family) | Vertebrata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome context (mm10) |
chr4: 63256867-63256923 [+] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Precursor (pre-Mir +30nt flank) | CAUCCUGUGCUGCCCUCCCUGGUGUGAGCGUAUGUGCCUUUGGACUACAUCGUGAACGCAGCACCAUGCAGUCCACGGGCAUAUACACUUGCCUCAAGGUCUAUGUCAUCGAGGACCGet precursor sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Structure | 10 20 30 40 50 CAUCCUGUGCUGCCCUC- -| U UG C U A C UGAAC CC UGG G AG GUAUGUGCCU UGGACU CAU G \ GG ACU C UC CAUAUACGGG ACCUGA GUA C G CCAGGAGCUACUGUAUCU A^ C GU A C C C ACGAC 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Deep sequencing |
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Comment | There are mutliple Dicer cuts on the 3p arm. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Motifs | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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Mature sequence | Mmu-Mir-455_5p |
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mirBase accession | MIMAT0003485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
0- UAUGUGCCUUUGGACUACAUCG -22
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003485 TargetScanVert: mmu-miR-455-5p miRDB: MIMAT0003485 |
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Star sequence | Mmu-Mir-455_3p* |
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mirBase accession | MIMAT0003742 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence |
35- AUGCAGUCCACGGGCAUAUACA -57
Get sequence
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Proposed targets |
microrna.org: MIMAT0003742 TargetScanVert: mmu-miR-455-3p.1 miRDB: MIMAT0003742 |